Egysejtű (Single-cell) genommásolatszám-variáció elemzés
Az egysejtű genommásolatszám-variáció (scCNV) elemzés genomikus szegmensek nyereségeit és veszteségeit azonosítja az egyes sejteken belül, lehetővé téve a kutatók számára a tumoron belüli heterogenitás feloldását, a klonális evolúció rekonstruálását és a rosszindulatú sejtek megkülönböztetését a normál sejtektől egysejtű felbontásban. Alkalmazható közvetlenül egysejtű teljes genom szekvenálási adatokra, vagy következtethető le az scRNA-seq vagy scATAC-seq kísérletek olvasási mélység (read-depth) jeleiből.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- Copy Number Variation AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtes epigenom-szintű asszociációs vizsgálat (scEWAS)Bioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtes GWASBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtű RNS-szekvenálási differenciálexpressziós analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- VariánsdetektálásBioinformatika↔ összehasonlítás
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →