Egysejtű filogenetikai analízis — törzsfák rekonstrukciója egysejtű feloldóképességgel
Az egysejtű filogenetikai analízis evolúciós vagy fejlődési törzsfákat rekonstruál egysejtű szekvenálási adatokból, követve, hogyan váltak le az egyes sejtek egy közös ősanyagtól. Szomatikus mutációk, CRISPR-bevezetett bar-kódok vagy másolatszám-változások öröklődő jellemzőkként való felhasználásával ez a módszer tumorok, fejlődő szövetek vagy immunrepertoárok klonális kapcsolatait tárja fel példátlan sejt feloldóképességgel.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- Copy Number Variation AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Filogenetikai elemzésBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- VariánsdetektálásBioinformatika↔ összehasonlítás
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →