ฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์

ฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์คือป้ายกำกับสรุป – เมแทบอไลเซอร์ต่ำ, ปานกลาง, ปกติ หรือรวดเร็วเป็นพิเศษ – ที่อธิบายว่าบุคคลนั้นคาดว่าจะเมแทบอไลซ์สารตั้งต้นของเอนไซม์เฉพาะได้เร็วเพียงใด โดยอิงจากการรวมกันของอัลลีลที่แตกต่างกันที่พวกเขามีอยู่ หมวดหมู่เหล่านี้จะแปลจีโนไทป์ที่ซับซ้อนให้เป็นข้อความที่ตีความได้เกี่ยวกับความสามารถในการเมแทบอไลซ์ หัวข้อนี้กล่าวถึงวิธีการที่จีโนไทป์ถูกจับคู่กับฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์ และวิธีการที่คำศัพท์ฟีโนไทป์เหล่านั้นได้รับการกำหนดมาตรฐาน

Definition

ฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์คือคำอธิบายเชิงหมวดหมู่ของกิจกรรมเอนไซม์ที่คาดการณ์ไว้ของแต่ละบุคคลสำหรับฟาร์มาโคจีนที่กำหนด – โดยทั่วไปคือเมแทบอไลเซอร์ต่ำ, ปานกลาง, ปกติ หรือรวดเร็วเป็นพิเศษ – ซึ่งอนุมานจากหน้าที่ของอัลลีลสองตัวที่ได้รับสืบทอด (ไดโพลไทป์)

Scope

หัวข้อนี้ครอบคลุมหมวดหมู่มาตรฐานของฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์ หลักการของการอนุมานฟีโนไทป์จากไดโพลไทป์ (คู่ของอัลลีลที่ได้รับสืบทอด) แนวทางการให้คะแนนกิจกรรมที่ใช้สำหรับยีน เช่น CYP2D6 และความพยายามในการประสานคำศัพท์เพื่อให้ห้องปฏิบัติการรายงานผลลัพธ์ได้อย่างสอดคล้องกัน เป็นเอกสารอ้างอิงเกี่ยวกับการจำแนกประเภทและไม่ได้ให้คำแนะนำในการให้ยา

Core questions

• จีโนไทป์ของแต่ละบุคคลถูกแปลเป็นฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์ที่คาดการณ์ไว้ได้อย่างไร?
• หมวดหมู่เมแทบอไลเซอร์ต่ำ, ปานกลาง, ปกติ และรวดเร็วเป็นพิเศษ หมายความว่าอย่างไร?
• วิธีการให้คะแนนกิจกรรมกำหนดฟีโนไทป์จากไดโพลไทป์ได้อย่างไร?
• เหตุใดคำศัพท์ฟีโนไทป์ที่เป็นมาตรฐานจึงมีความสำคัญในห้องปฏิบัติการต่างๆ?

Key concepts

• ไดโพลไทป์ (คู่ของอัลลีลที่ได้รับสืบทอด)
• การกำหนดหน้าที่ของอัลลีล (ไม่มี, ลดลง, ปกติ, เพิ่มขึ้น)
• คะแนนกิจกรรม
• หมวดหมู่เมแทบอไลเซอร์ต่ำ, ปานกลาง, ปกติ และรวดเร็วเป็นพิเศษ
• การแปลจีโนไทป์เป็นฟีโนไทป์
• คำศัพท์ผลลัพธ์ที่เป็นมาตรฐาน

Mechanisms

อัลลีลที่แตกต่างกันแต่ละตัวของยีนที่เมแทบอไลซ์จะได้รับหน้าที่ – ไม่มีหน้าที่, หน้าที่ลดลง, หน้าที่ปกติ หรือหน้าที่เพิ่มขึ้น การรวมกันของอัลลีลสองตัวที่บุคคลนั้นมีอยู่ (ไดโพลไทป์ของพวกเขา) จะให้กิจกรรมโดยรวมที่คาดการณ์ไว้ ซึ่งสำหรับยีนบางชนิดจะถูกบันทึกเป็นตัวเลขเป็นคะแนนกิจกรรมแล้วจับคู่กับหมวดหมู่ฟีโนไทป์ บุคคลที่มีอัลลีลที่ไม่มีหน้าที่สองตัวคาดว่าจะเป็นเมแทบอไลเซอร์ต่ำ อัลลีลปกติหนึ่งหรือสองตัวจะให้เมแทบอไลเซอร์ปกติ การเพิ่มจำนวนยีนสามารถสร้างเมแทบอไลเซอร์ที่รวดเร็วเป็นพิเศษ และการรวมกันแบบปานกลางจะอยู่ระหว่างนั้น เนื่องจากนี่เป็นการคาดการณ์จากจีโนไทป์ ฟีโนไทป์ที่สังเกตได้ยังคงสามารถเปลี่ยนแปลงได้โดยปฏิกิริยาระหว่างยา การทำงานของอวัยวะ และปัจจัยอื่นๆ

Clinical relevance

ฟีโนไทป์ของการเมแทบอไลซ์เป็นผลลัพธ์เชิงปฏิบัติของการทดสอบเภสัชพันธุศาสตร์สำหรับยีนที่เมแทบอไลซ์ และเป็นรูปแบบที่ข้อมูลจีโนไทป์ถูกสื่อสารเพื่อการตีความ ในฐานะเนื้อหาอ้างอิง หัวข้อนี้อธิบายความหมายของหมวดหมู่และวิธีการได้มา ซึ่งไม่ได้ระบุว่าฟีโนไทป์ใดควรได้รับยาในปริมาณเท่าใด ซึ่งกำหนดโดยแนวทางปฏิบัติทางคลินิกที่ได้รับการตรวจสอบแล้วซึ่งนำไปใช้โดยแพทย์ผู้ทรงคุณวุฒิกับสถานการณ์ทางคลินิกทั้งหมด

Epidemiology

สัดส่วนของประชากรในแต่ละหมวดหมู่ของการเมแทบอไลซ์แตกต่างกันอย่างมากตามประชากรบรรพบุรุษ เนื่องจากความถี่ของอัลลีลพื้นฐานแตกต่างกันไป สำหรับเอนไซม์บางชนิด สัดส่วนที่น่าสังเกตของประชากรบางกลุ่มเป็นเมแทบอไลเซอร์ต่ำหรือรวดเร็วเป็นพิเศษ ซึ่งเป็นเหตุผลว่าทำไมข้อมูลประชากรจึงมาพร้อมกับการตีความฟีโนไทป์

History

แนวคิดของกลุ่มเมแทบอไลเซอร์ที่แตกต่างกันเกิดขึ้นจากการศึกษาฝาแฝดและครอบครัวในยุคแรกๆ ที่แสดงให้เห็นการกระจายตัวของการเมแทบอไลซ์ยาแบบสองโหมด เมื่อการหาลำดับจีโนไทป์เข้ามาแทนที่การทดสอบเมแทบอไลซ์โดยตรง สาขาจึงต้องการวิธีการที่สอดคล้องกันในการแปลจีโนไทป์เป็นป้ายกำกับฟีโนไทป์ ซึ่งนำไปสู่ระบบคะแนนกิจกรรมสำหรับ CYP2D6 และฉันทามติของ Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium ในปี 2017 ที่กำหนดมาตรฐานคำศัพท์ที่ใช้ในรายงานการทดสอบ

Debates

ควรนิยามหมวดหมู่เมแทบอไลเซอร์ปานกลางอย่างไร?

แผนการที่แตกต่างกันได้กำหนดขอบเขตคะแนนกิจกรรมระหว่างเมแทบอไลเซอร์ต่ำ, ปานกลาง และปกติแตกต่างกันไป และความพยายามในการประสานงานได้แสวงหาฉันทามติเพื่อให้จีโนไทป์เดียวกันให้ป้ายกำกับฟีโนไทป์เดียวกันในห้องปฏิบัติการต่างๆ

Key figures

• Kelly Caudle
• Teri Klein
• Mary Relling
• Andrea Gaedigk

Seminal works

• caudle-2017
• weinshilboum-2003

Frequently asked questions

การเป็นเมแทบอไลเซอร์ต่ำหมายความว่าอย่างไร?

เป็นฟีโนไทป์ที่คาดการณ์ไว้ซึ่งบ่งชี้ว่า จากอัลลีลที่แตกต่างกันที่บุคคลนั้นมีอยู่ เอนไซม์ที่เกี่ยวข้องคาดว่าจะมีกิจกรรมน้อยหรือไม่เลย ดังนั้นยาที่เป็นสารตั้งต้นจะถูกเมแทบอไลซ์ช้ามาก เป็นการจำแนกความสามารถในการเมแทบอไลซ์ ไม่ใช่คำแนะนำในการรักษา

ฟีโนไทป์ที่คาดการณ์โดยจีโนไทป์ของบุคคลอาจแตกต่างจากการที่พวกเขาเมแทบอไลซ์ยาจริงหรือไม่?

ได้ ฟีโนไทป์เป็นการคาดการณ์จากจีโนไทป์ และปัจจัยต่างๆ เช่น ยาที่ทำปฏิกิริยาซึ่งยับยั้งหรือกระตุ้นเอนไซม์ โรคตับหรือไต และอายุ สามารถเปลี่ยนกิจกรรมเมแทบอไลซ์ที่สังเกตได้ให้ห่างจากการคาดการณ์ตามจีโนไทป์ได้