Analýza variácií počtu kópií v jednotlivých bunkách
Analýza variácií počtu kópií v jednotlivých bunkách (scCNV) deteguje prírastky a straty genómových segmentov v rámci jednotlivých buniek, čo umožňuje výskumníkom rozlíšiť intratumorálnu heterogenitu, rekonštruovať klonálnu evolúciu a odlíšiť malígne bunky od normálnych buniek v rozlíšení na úrovni jednej bunky. Môže byť aplikovaná priamo na dáta zo sekvenovania celého genómu jednotlivých buniek (scWGS) alebo odvodená zo signálov hĺbky čítania v experimentoch scRNA-seq alebo scATAC-seq.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza variácií počtu kópiíBioinformatika↔ porovnať
- Asociatívna štúdia epigenómu v jedinej bunke (scEWAS)Bioinformatika↔ porovnať
- Single-cell GWASBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
- Diferenciálna expresná analýza jednobunkovej RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Variant CallingBioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →