Analýza fylogenézy jednobunkových organizmov — Rekonštrukcia stromov línií s rozlíšením na úrovni jednotlivých buniek
Analýza fylogenézy jednobunkových organizmov rekonštruuje evolučné alebo vývojové stromy z údajov sekvenovania jednotlivých buniek, pričom sleduje, ako sa jednotlivé bunky vyvinuli zo spoločného predka. Využitím somatických mutácií, čipov zavedených pomocou CRISPR alebo zmien počtu kópií ako dedičných znakov, táto metóda mapuje klonálne vzťahy v rámci nádorov, vyvíjajúcich sa tkanív alebo imunitných repertoárov s bezprecedentným bunkovým rozlíšením.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza variácií počtu kópiíBioinformatika↔ porovnať
- Fylogenetická analýzaBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
- Variant CallingBioinformatika↔ porovnať
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →