Volanie pík v rámci profilovania epigenómu scChIP-seq
Volanie pík v rámci scChIP-seq je bioinformatický pipeline, ktorý identifikuje genómové regióny obohatené o histónové modifikácie alebo väzbu transkripčných faktorov v jednotlivých bunkách. Profilovaním stavov chromatínu s rozlíšením na jednotlivé bunky odhaľuje epigenómovú heterogenitu skrytú v experimentoch ChIP-seq z hromadných vzoriek, čo umožňuje výskumníkom mapovať regulačné krajiny naprieč odlišnými populáciami buniek v rámci komplexnej vzorky tkaniva.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatika↔ porovnať
- Epigenóm-široká asociačná štúdia (EWAS)Bioinformatika↔ porovnať
- Asociatívna štúdia epigenómu v jedinej bunke (scEWAS)Bioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
- Zarovnávanie sekvencií z jednotlivých buniekBioinformatika↔ porovnať
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →