Одноклеточный филогенетический анализ — реконструкция деревьев потомственности с разрешением на уровне отдельных клеток
Одноклеточный филогенетический анализ реконструирует эволюционные или онтогенетические деревья на основе данных секвенирования отдельных клеток, отслеживая, как отдельные клетки разошлись от общего предка. Используя соматические мутации, штрих-коды, введенные CRISPR, или изменения числа копий в качестве наследуемых признаков, этот метод картирует клональные отношения внутри опухолей, развивающихся тканей или иммунных репертуаров с беспрецедентным клеточным разрешением.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ сравнить
- Филогенетический анализБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →