РНК-скорость
РНК-скорость — это вычислительный метод, который определяет будущее состояние развития отдельных клеток на основе данных одноклеточного секвенирования РНК. Разработанный Ла Манно и его коллегами в 2018 году, анализ РНК-скорости измеряет направление и темп переходов клеточного состояния путем анализа соотношения несплайсированных и сплайсированных мРНК-транскриптов в отдельных клетках. Это позволяет предсказывать клеточные траектории и пути дифференцировки без необходимости временного отбора проб или манипуляций, предоставляя уникальное представление о решениях клеточной судьбы во время развития и болезней.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/genetics/rna-velocity
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ ATAC-seqГенетика↔ сравнить
- Анализ Hi-CГенетика↔ сравнить
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →