ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Variant Calling — Genomische Variant Calling

Variant calling is het computationele proces om posities in een gesequenced genoom te identificeren die verschillen van een referentiereeks — inclusief single nucleotide polymorphisms (SNPs), kleine inserties en deleties (indels), en structurele varianten. Het transformeert uitgelijnde sequencing reads in een interpreteerbare catalogus van genetische verschillen, wat de basis vormt voor populatiegenetica, ontdekking van ziektegenen en klinische genomica-toepassingen.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDownload slides

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.

Inloggen

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

+14 more

Bronnen

  1. McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI: 10.1101/gr.107524.110
  2. Li, H., Handsaker, B., Wysoker, A., Fennell, T., Ruan, J., Homer, N., ... & Durbin, R. (2009). The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics, 25(16), 2078–2079. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/variant-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Geciteerd door

ScholarGateVariant Calling (Genomic Variant Calling). Geraadpleegd op 2026-06-15 via https://scholargate.app/nl/bioinformatics/variant-calling · Gegevensset: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026