Variant Calling — Genomische Variant Calling
Variant calling is het computationele proces om posities in een gesequenced genoom te identificeren die verschillen van een referentiereeks — inclusief single nucleotide polymorphisms (SNPs), kleine inserties en deleties (indels), en structurele varianten. Het transformeert uitgelijnde sequencing reads in een interpreteerbare catalogus van genetische verschillen, wat de basis vormt voor populatiegenetica, ontdekking van ziektegenen en klinische genomica-toepassingen.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+14 more
Bronnen
- McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI: 10.1101/gr.107524.110 ↗
- Li, H., Handsaker, B., Wysoker, A., Fennell, T., Ruan, J., Homer, N., ... & Durbin, R. (2009). The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics, 25(16), 2078–2079. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analyse van kopienummervariatieBio-informatica↔ compare
- Epigenoom-brede associatiestudie (EWAS)Bio-informatica↔ compare
- Genoombrede associatiestudie (GWAS)Bio-informatica↔ compare
- RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ compare
- Sequentie-uitlijningBio-informatica↔ compare
- Single-cell variant callingBio-informatica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →