Single-cell variant calling — mutaties detecteren op cellulaire resolutie
Single-cell variant calling is een bio-informatica pipeline die DNA-sequentievarianten — single-nucleotide varianten (SNV's), kleine inserties en deleties, en copy-number alteraties — identificeert binnen individuele cellen in plaats van in een bulkweefselmengsel. Door het mutationele landschap cel voor cel te ontrafelen, onthult het intratumorale heterogeniteit, klonale architectuur en somatische mutatiepatronen die bulksequencing verhult. De benadering is cruciaal voor kankergenomica, ontwikkelingsbiologie en elke studie waarbij cel-tot-cel genetische diversiteit de primaire onderzoeksvraag is.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Bronnen
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analyse van kopienummervariatieBio-informatica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →