ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Single-cell variant calling — mutaties detecteren op cellulaire resolutie

Single-cell variant calling is een bio-informatica pipeline die DNA-sequentievarianten — single-nucleotide varianten (SNV's), kleine inserties en deleties, en copy-number alteraties — identificeert binnen individuele cellen in plaats van in een bulkweefselmengsel. Door het mutationele landschap cel voor cel te ontrafelen, onthult het intratumorale heterogeniteit, klonale architectuur en somatische mutatiepatronen die bulksequencing verhult. De benadering is cruciaal voor kankergenomica, ontwikkelingsbiologie en elke studie waarbij cel-tot-cel genetische diversiteit de primaire onderzoeksvraag is.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDownload slides

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.

Inloggen

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Bronnen

  1. Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835
  2. Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-variant-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Geciteerd door

ScholarGateSingle-cell variant calling (Single-Cell Genomic Variant Calling). Geraadpleegd op 2026-06-15 via https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-variant-calling · Gegevensset: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026