Single-cell Fylogenetische Analyse — Reconstructie van Lijnboom op Enkelcelresolutie
Single-cell fylogenetische analyse reconstrueert evolutionaire of ontwikkelingsbomen uit single-cell sequencingdata, waarbij wordt nagegaan hoe individuele cellen zich hebben afgesplitst van een gemeenschappelijke voorouder. Door somatische mutaties, CRISPR-geïntroduceerde barcodes of veranderingen in het aantal kopieën te gebruiken als erfelijk materiaal, brengt deze methode clonale relaties binnen tumoren, ontwikkelende weefsels of immuunrepertoires in kaart met een ongekende cellulaire resolutie.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- Analyse van kopienummervariatieBio-informatica↔ vergelijken
- Fylogenetische AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
- Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
- Variant CallingBio-informatica↔ vergelijken
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →