Process / pipelineBioinformatics / omics

Single-cell Copy Number Variation Analysis

Single-cell copy number variation (scCNV)-analyse detecteert winsten en verliezen van genomische segmenten binnen individuele cellen, waardoor onderzoekers intratumorale heterogeniteit kunnen oplossen, clonale evolutie kunnen reconstrueren en maligne van normale cellen kunnen onderscheiden met single-cell resolutie. Het kan direct worden toegepast op single-cell whole-genome sequencing data of worden afgeleid uit read-depth signalen in scRNA-seq of scATAC-seq experimenten.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDia's downloaden

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Inloggen

Methodenkaart

De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.

Single-cell Copy Number Variation Analysis

Analyse van kopienummerv…Single-cell epigenome-wi…Single-cell GWAS Single-cell RNA-seq Anal…Differentiële expressiea…Variant Calling Bayesiaanse analyse van…Machine learning-onderst…Tijdreeksanalyse van Kop…

Bronnen

Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis

Welke methode?

Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.

Analyse van kopienummervariatieBio-informatica↔ vergelijken
Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)Bio-informatica↔ vergelijken
Single-cell GWASBio-informatica↔ vergelijken
Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
Differentiële expressieanalyse van single-cell RNA-seqBio-informatica↔ vergelijken
Variant CallingBio-informatica↔ vergelijken

Naast elkaar vergelijken →

Geciteerd door

Bayesiaanse analyse van genoomkopie-aantalsvariaties Analyse van kopienummervariatie Machine learning-ondersteunde analyse van kopienummervariaties Tijdreeksanalyse van Kopiërenummer Variaties

Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →