Analyse van kopienummervariatie — Detectie en interpretatie van CNV's
Analyse van kopienummervariatie (CNV) is een genomische pijplijn voor het detecteren van regio's waar individuen minder of meer kopieën van een DNA-segment hebben dan het referentiegenoom. CNV's bestrijken kilobasen tot megabasen en zijn een belangrijke klasse van structurele variatie die betrokken is bij kanker, neurodevelopmentele stoornissen en populatiediversiteit. De pijplijn verwerkt doorgaans SNP-array-intensiteiten of read-depth-signalen van whole-genome sequencing, past segmentatie-algoritmen toe, roept gain- en loss-gebeurtenissen aan en annoteert deze tegen gen- en klinische databases.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+9 more
Bronnen
- Redon, R., Ishikawa, S., Fitch, K. R., et al. (2006). Global variation in copy number in the human genome. Nature, 444(7118), 444–454. DOI: 10.1038/nature05329 ↗
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Epigenoom-brede associatiestudie (EWAS)Bio-informatica↔ compare
- Genoombrede associatiestudie (GWAS)Bio-informatica↔ compare
- RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ compare
- Sequentie-uitlijningBio-informatica↔ compare
- Single-cell Copy Number Variation AnalysisBio-informatica↔ compare
- Variant CallingBio-informatica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →