Bayesian Sequence Alignment — Probabilistische Uitlijning met Kwantificering van Onzekerheid

Bayesiaanse sequentie-uitlijning beschouwt de uitlijning van biologische sequenties (DNA, RNA of eiwit) als een probabilistisch inferentieprobleem in plaats van een deterministische optimalisatie. In plaats van één enkele beste uitlijning te retourneren, sampelt het uit een posterieure verdeling over alle plausibele uitlijningen, gegeven een substitutiemodel en priors voor gap-straffen, waardoor de onzekerheid van de uitlijning wordt gekwantificeerd. Het is bijzonder waardevol wanneer downstream-analyses zoals fylogenetische inferentie of functionele annotatie gevoelig zijn voor uitlijningsfouten.