ScholarGate
Asistents
Process / pipelineBioinformatics / omics

Signālu ceļu bagātināšanas analīze — Bioloģisko signālu ceļu bagātināšanas analīze

Signālu ceļu bagātināšanas analīze (PEA) ir statistiska pieeja, kas izmanto interesējošo gēnu vai proteīnu sarakstu — parasti iegūtu no diferenciālās ekspresijas vai proteomikas eksperimenta — un identificē, kuri iepriekš definēti bioloģiskie signālu ceļi vai funkcionālie gēnu kopumi ir pārstāvēti biežāk, nekā nejauši sagaidāms. Kartējot individuālās molekulārās izmaiņas uz kurētām signālu ceļu zināšanu bāzēm, piemēram, KEGG, Gēnu Ontoloģija vai Reactome, PEA pārvērš garus gēnu sarakstus interpretējamos bioloģiskos procesos, padarot to par centrālo rīku augstas caurlaidības omikas eksperimentu pēcanalīzē.

Atvērt MethodMindDrīzumāVideoDrīzumāLejupielādēt slaidus

Lasīt pilno metodes aprakstu

Tikai dalībniekiem

Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.

Pieteikties

Metožu karte

Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.

Signālu ceļu bagātināšanas analīze
GSEA (Gēnu kopu bagātinā…Analīze "Metabolomika"Tīkla analīze ceļu bagāt…Proteīnu analīzeRNA-seq diferenciālās ek…Vienšūnas RNS sekvencēša…Bayesian ChIP-seq Peak C…Beiziešu eQTL analīzeBayesian Gene Set Enrich…Beiziešu GWAS

+vēl 43

Avoti

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
  2. Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Kā citēt šo lapu

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Kura metode?

Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.

Salīdzināt blakus →

Uz to atsaucas

Bayesian ChIP-seq Peak CallingBeiziešu eQTL analīzeBayesian Gene Set Enrichment AnalysisBeiziešu GWASBejeziešu metabolomikas analīzeBejeziāņu ceļu bagātināšanas analīzeBeiziešu proteomikas analīzeBeiziešu RNS-sekvencēšanas diferenciālās ekspresijas analīzeDiferenciālā epigenoma plaša mēroga asociācijas pētījumsDiferenciālā eQTL analīzeDiferenciālā metabolomikas analīzeDiferenciālā ceļu bagātināšanas analīzeDiferenciālā proteomikas analīzeEpigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS)eQTL analīzeGSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Ar mašīnmācīšanos saistīta eQTL analīzeGēnu kopu bagātināšanas analīze, izmantojot mašīnmācīšanosMašīnmācīšanās palīdzības mikrobiomu daudzveidības analīzeMašīnmācīšanās atbalstīta RNS-sekvenēšanas diferenciālās ekspresijas analīzeAnalīze ar mašīnmācīšanos atbalstītu vienšūnu RNS sekvencēšanuAnalīze "Metabolomika"Daudzomu epigenoma plaša asociācijas pētījumsDaudzomikas gēnu kopu bagātināšanas analīzeMulti-omics metabolomīkās analīzeDaudzomu mikrobioma daudzveidības analīzeDaudzomu proteīmu analīzeVienas šūnas RNS-sekvenēšanas (scRNA-seq) daudzatmiju analīzeAnalīze tīklos balstīta kopiju skaita variācijāmNetwork-based epigenome-wide association studyTīklam balstīta eQTL analīzeTīkla balstīta gēnu kopu bagātināšanas analīzeTīklā balstīta GWASAnalīze, kas balstīta uz tīkliem, metabolomikāAnalīze tīklos balstītai mikrobiomu daudzveidībaiTīklā balstīta RNA-seq diferenciālās ekspresijas analīzeTīklos balstīta vienšūnu RNS sekvenču analīzeProteīnu analīzeRNA-seq diferenciālās ekspresijasVienšūnu eQTL analīzeVienšūnu gēnu kopu bagātināšanas analīzeVienšūnu GWASVienšūnu metabolomikas analīzeVienšūnas RNS sekvencēšanas analīzeVienšūnu RNS sekvenēšanas (scRNA-seq) diferenciālās ekspresijas analīzeLaika sēriju gēnu kopu bagātināšanas analīzeLaika sēriju metabolomikas analīzeLaika sēriju mikrobioma daudzveidības analīzeLaika sēriju ceļu bagātināšanas analīzeDiferenciālās ekspresijas analīze laika sērijās, izmantojot RNA-seqLaika sēriju vienšūnu RNS sekvenēšanas analīze

Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →

ScholarGate — Pathway Enrichment Analysis (Biological Pathway Enrichment Analysis). Izgūts 2026-06-15 no https://scholargate.app/lv/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis · Datu kopa: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026