ScholarGate
Asistents
Process / pipelineBioinformatics / omics

GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)

GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze) ir aprēķinu metode, kas nosaka, vai iepriekš definēta gēnu kopa — kas attēlo bioloģisko ceļu, procesu vai funkciju — uzrāda statistiski nozīmīgas, koordinētas atšķirības starp diviem bioloģiskiem stāvokļiem. Atšķirībā no vienkāršas izmaiņu koeficienta filtrēšanas, GSEA darbojas ar visiem izmērītajiem gēniem, kas sakārtoti pēc korelācijas metrikas, nosakot smalkas, bet konsekventas izmaiņas visā ceļā, pat ja neviens atsevišķs gēns nepārsniedz nozīmīguma slieksni.

Atvērt MethodMindDrīzumāApply, compare, get guidance
Tools & resources
Lejupielādēt slaidus
Learn & explore
VideoDrīzumā

Lasīt pilno metodes aprakstu

Tikai dalībniekiem

Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.

Pieteikties

Metožu karte

Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.

GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)
Daudzomikas gēnu kopu ba…Tīkla balstīta gēnu kopu…Signālu ceļu bagātināšan…RNA-seq diferenciālās ek…Vienšūnas RNS sekvencēša…Bayesian Gene Set Enrich…Björiešu mikrobiomu daud…Bejeziāņu ceļu bagātināš…Beiziešu RNS-sekvencēšan…Diferenciālā ChIP-seq pī…

+vēl 27

Avoti

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
  2. Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Kā citēt šo lapu

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Kura metode?

Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.

Salīdzināt blakus →

Uz to atsaucas

Bayesian Gene Set Enrichment AnalysisBjöriešu mikrobiomu daudzveidības analīzeBejeziāņu ceļu bagātināšanas analīzeBeiziešu RNS-sekvencēšanas diferenciālās ekspresijas analīzeDiferenciālā ChIP-seq pīķu noteikšanaDiferenciālā ceļu bagātināšanas analīzeeQTL analīzeGēnu kopu bagātināšanas analīze, izmantojot mašīnmācīšanosMašīnmācīšanās atbalstīta ceļu bagātināšanas analīzeMašīnmācīšanās atbalstīta RNS-sekvenēšanas diferenciālās ekspresijas analīzeAnalīze ar mašīnmācīšanos atbalstītu vienšūnu RNS sekvencēšanuAnalīze "Metabolomika"Daudzomikas gēnu kopu bagātināšanas analīzeMulti-omics metabolomīkās analīzeDaudzomu mikrobioma daudzveidības analīzeDaudzomu šķērsviršķu bagātības analīzeDaudzomu proteīmu analīzeDaudzomu RNS-seq diferenciālās ekspresijas analīzeVienas šūnas RNS-sekvenēšanas (scRNA-seq) daudzatmiju analīzeAnalīze tīklos balstīta kopiju skaita variācijāmTīkla balstīta gēnu kopu bagātināšanas analīzeTīklā balstīta GWASAnalīze, kas balstīta uz tīkliem, metabolomikāAnalīze tīklos balstītai mikrobiomu daudzveidībaiTīkla analīze ceļu bagātināšanaiTīklā balstīta RNA-seq diferenciālās ekspresijas analīzeTīklos balstīta vienšūnu RNS sekvenču analīzeSignālu ceļu bagātināšanas analīzeProteīnu analīzeRNA-seq diferenciālās ekspresijasVienšūnu gēnu kopu bagātināšanas analīzeVienšūnas RNS sekvencēšanas analīzeVienšūnu RNS sekvenēšanas (scRNA-seq) diferenciālās ekspresijas analīzeLaika sēriju gēnu kopu bagātināšanas analīzeLaika sēriju ceļu bagātināšanas analīzeDiferenciālās ekspresijas analīze laika sērijās, izmantojot RNA-seqLaika sēriju vienšūnu RNS sekvenēšanas analīze

Similar methods

Pathway Enrichment AnalysisBayesian Gene Set Enrichment AnalysisMulti-omics gene set enrichment analysisNetwork-based gene set enrichment analysisMachine learning-assisted gene set enrichment analysisDifferential pathway enrichment analysisBayesian Pathway Enrichment AnalysisTime-series gene set enrichment analysis

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network AnalysisFunctional Genomics and Pathway AnalysisGene Ontology and Biological DatabasesGene Expression Signatures and Prognostic MarkersTranscriptomics and Gene Expression AnalysisSystems Genomics and Network Biology

Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →

ScholarGate — Gene Set Enrichment Analysis (Gene Set Enrichment Analysis). Izgūts 2026-06-17 no https://scholargate.app/lv/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis · Datu kopa: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026