Laika sēriju vienšūnu RNS sekvenēšanas analīze — Temporālā transkriptomika vienšūnu izšķirtspējā
Laika sēriju vienšūnu RNS sekvenēšanas analīze uztver gēnu ekspresiju vairākos laika punktos vienšūnu izšķirtspējā, lai atklātu, kā šūnu populācijas rodas, pāriet un atšķiras dinamisku bioloģisku procesu laikā, piemēram, attīstības, diferenciācijas vai slimības progresēšanas laikā. Apvienojot pseidolaika kārtošanu, RNS ātrumu un diferenciālās dinamikas testēšanu, pētnieki rekonstruē atsevišķu šūnu temporālo trajektoriju un identificē gēnu regulatīvās izmaiņas, kas vada bioloģiskās pārejas.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
Avoti
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- Kopiju skaita variāciju analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- eQTL analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)Bioinformātika↔ salīdzināt
- Signālu ceļu bagātināšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- RNA-seq diferenciālās ekspresijasBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnas RNS sekvencēšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Similar methods
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →