Tīklā balstīta GWAS — Tīklā balstīta genoma mēroga asociācijas pētījums
Tīklā balstīta GWAS integrē konvencionālus genoma mēroga asociācijas pētījumu rezultātus ar bioloģisko tīklu datiem — piemēram, olbaltumvielu-olbaltumvielu mijiedarbības (PPI) tīkliem vai gēnu koekspresijas grafikiem —, lai identificētu ar slimībām saistītus gēnu moduļus vai apakštīklus. Tā vietā, lai ziņotu tikai par labākajiem atsevišķajiem SNP, šī pieeja izplata asociācijas signālus caur molekulārās mijiedarbības tīkliem, atklājot gēnu kopas, kuru kolektīvais signāls tās iesaista kompleksu pazīmju bioloģijā pat tad, ja neviens variants viens pats nesasniedz genoma mēroga nozīmīgumu.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
Avoti
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/network-based-gwas
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- Kopiju skaita variāciju analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- eQTL analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)Bioinformātika↔ salīdzināt
- Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Bioinformātika↔ salīdzināt
- Tīklam balstīta eQTL analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Signālu ceļu bagātināšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →