Daudzomikas gēnu kopu bagātināšanas analīze
Daudzomikas gēnu kopu bagātināšanas analīze (multi-omics GSEA) ir aprēķinu pipeline, kas vienlaicīgi piemēro GSEA loģiku diviem vai vairākiem molekulāro mērījumu slāņiem — piemēram, transkriptomikai, proteomikai un metabolomikai — lai identificētu bioloģiskos pathway vai gēnu kopas, kas ir koordinēti disregulētas dažādās omikas platformās. Integrējot katra slāņa sakārtotus molekulāros parakstus, tā atklāj pathway līmeņa konverģenci, ko nevarētu noteikt tikai ar vienu omikas platformu.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
Avoti
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Meng, C., Zeleznik, O. A., Thallinger, G. G., Kuster, B., Gholami, A. M., & Culhane, A. C. (2016). Dimension reduction techniques for the integrative analysis of multi-omics data. Briefings in Bioinformatics, 17(4), 628–641. DOI: 10.1093/bib/bbv108 ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/multi-omics-gene-set-enrichment-analysis
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- GSEA (Gēnu kopu bagātināšanas analīze)Bioinformātika↔ salīdzināt
- Daudzomu šķērsviršķu bagātības analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Signālu ceļu bagātināšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Proteīnu analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- RNA-seq diferenciālās ekspresijasBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnu gēnu kopu bagātināšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Similar methods
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →