Process / pipelineBioinformatics / omics

Epigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS)

Epigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS) ir hipoēže-free, genoma mēroga metode, kas sistemātiski pārbauda, vai atšanās ir epigentiskie marķījumi — galvenokārtārti CpG vietu DNS metilācija — starp indivīdiem ar un bez noteiktas īpašības, slimības vai iedarbības. Vienlaicīgi skenējot simtiem tūkstotšu genoma pozīciju, EWAS identificē lokusus, kuros epigenoms ir reproducējami saistīts ar fenotipu, piedāvājot bioloġiskās regulācijas slāni, ko klasiskie GWAS neuztver.

Atvērt MethodMindDrīzumāApply, compare, get guidance

Tools & resources

Lejupielādēt slaidus

Learn & explore

VideoDrīzumā

Lasīt pilno metodes aprakstu

Tikai dalībniekiem

Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.

Pieteikties

Metožu karte

Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.

Epigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS)

ChIP-seq Peak Calling Kopiju skaita variāciju…eQTL analīze Ģenoma plaša asociācijas…Signālu ceļu bagātināšan…Bayesian ChIP-seq Peak C…Beijes Epigenoma-Wide As…Diferenciālā ChIP-seq pī…Diferenciālā epigenoma p…Mašīnmācīšanās atbalstīt…

+vēl 7

Avoti

Rakyan, V. K., Down, T. A., Balding, D. J., & Beck, S. (2011). Epigenome-wide association studies for common human diseases. Nature Reviews Genetics, 12(8), 529–541. DOI: 10.1038/nrg3000 ↗
Pidsley, R., Zotenko, E., Peters, T. J., Lawrence, M. G., Risbridger, G. P., Molloy, P., Van Djik, S., Muhlhausler, B., Stirzaker, C., & Clark, S. J. (2016). Critical evaluation of the Illumina MethylationEPIC BeadChip microarray for whole-genome DNA methylation profiling. Genome Biology, 17(1), 208. DOI: 10.1186/s13059-016-1066-1 ↗

Kā citēt šo lapu

ScholarGate. (2026, June 3). Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/epigenome-wide-association-study

Kura metode?

Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.

ChIP-seq Peak CallingBioinformātika↔ salīdzināt
Kopiju skaita variāciju analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
eQTL analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Bioinformātika↔ salīdzināt
Signālu ceļu bagātināšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt

Salīdzināt blakus →

Uz to atsaucas

Bayesian ChIP-seq Peak Calling Beijes Epigenoma-Wide Association Study (Bayesian EWAS)ChIP-seq Peak Calling Kopiju skaita variāciju analīze Diferenciālā ChIP-seq pīķu noteikšana Diferenciālā epigenoma plaša mēroga asociācijas pētījums Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Mašīnmācīšanās atbalstīta ChIP-seq pīķu noteikšana Daudzomu epigenoma plaša asociācijas pētījums Network-based epigenome-wide association study Vienšūnu ChIP-seq pīķu noteikšana Viena šūnu epigenoma plašā asociācijas pētījuma (scEWAS) apraksts Laika secīgu ChIP-seq pīķu noteikšana Laika sēriju epigenoma plašās asociācijas pētījumi Variantu identificēšana

Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →