Kopiju skaita variāciju analīze — CNV noteikšana un interpretācija
Kopiju skaita variāciju (CNV) analīze ir genoma analīzes process, lai noteiktu reģionus, kuros indivīdiem ir mazāk vai vairāk DNS segmentu kopiju nekā references genomā. CNV aptver kilobāzus līdz megabāzēm un ir galvenā strukturālo variāciju klase, kas saistīta ar vēzi, neiroattīstības traucējumiem un populācijas daudzveidību. Šis process parasti apstrādā SNP masīvu intensitātes vai nolasījumu dziļuma signālus no visa genoma sekvencēšanas, pielieto segmentācijas algoritmus, nosaka ieguvumu un zudumu notikumus un anotē tos, izmantojot gēnu un klīniskās datubāzes.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
+vēl 9
Avoti
- Redon, R., Ishikawa, S., Fitch, K. R., et al. (2006). Global variation in copy number in the human genome. Nature, 444(7118), 444–454. DOI: 10.1038/nature05329 ↗
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/copy-number-variation-analysis
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- Epigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS)Bioinformātika↔ salīdzināt
- Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Bioinformātika↔ salīdzināt
- RNA-seq diferenciālās ekspresijasBioinformātika↔ salīdzināt
- Secvenču salīdzināšanaBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnu kopiju skaita variācijas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Variantu identificēšanaBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →