Vienšūnu kopiju skaita variācijas analīze
Vienšūnu kopiju skaita variācijas (scCNV) analīze nosaka ģenomu segmentu pieaugumus un zudumus atsevišķās šūnās, ļaujot pētniekiem izšķirt intratektorālo heterogenitāti, rekonstruēt klonu evolūciju un atšķirt ļaundabīgas šūnas no normālām šūnām vienas šūnas izšķirtspējā. To var tieši piemērot vienšūnu pilngenoma sekvenēšanas datiem vai secināt no nolasījumu dziļuma signāliem scRNA-seq vai scATAC-seq eksperimentos.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Metožu karte
Saistīto metožu apkaime — atlasiet mezglu, lai izpētītu.
Avoti
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Kura metode?
Novietojiet šo metodi blakus tās tuvākajām radniecīgajām metodēm un lasiet tās līdzās — bibliotēka noliek grāmatas uz galda; izvēle ir jūsu.
- Kopiju skaita variāciju analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Viena šūnu epigenoma plašā asociācijas pētījuma (scEWAS) aprakstsBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnu GWASBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnas RNS sekvencēšanas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Vienšūnu RNS sekvenēšanas (scRNA-seq) diferenciālās ekspresijas analīzeBioinformātika↔ salīdzināt
- Variantu identificēšanaBioinformātika↔ salīdzināt
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →