Variantu identificēšana — ģenomisko variantu identificēšana
Variantu identificēšana ir aprēķināšanas process, kurā tiek noteiktas sekvencētā genoma pozīcijas, kas atšķiras no atsauces sekvences — ieskaitot vienas nukleotīdu polimorfismus (SNP), nelielus ieliktņus un dzēsumus (indels) un strukturālos variantus. Tas pārvērš saskaņotos sekvenču nolasījumus interpretējamā ģenētisko atšķirību katalogā, veidojot pamatu populācijas ģenētikai, slimību gēnu atklāšanai un klīniskās ģenomikas lietojumprogrammām.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+14 more
Avoti
- McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI: 10.1101/gr.107524.110 ↗
- Li, H., Handsaker, B., Wysoker, A., Fennell, T., Ruan, J., Homer, N., ... & Durbin, R. (2009). The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics, 25(16), 2078–2079. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352 ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Kopiju skaita variāciju analīzeBioinformātika↔ compare
- Epigenomu plaša asociācijas pētījums (EWAS)Bioinformātika↔ compare
- Ģenoma plaša asociācijas pētījums (GWAS)Bioinformātika↔ compare
- RNA-seq diferenciālās ekspresijasBioinformātika↔ compare
- Secvenču salīdzināšanaBioinformātika↔ compare
- Vienšūnu variantu noteikšanaBioinformātika↔ compare
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →