दैहिक बनाम जर्मलाइन उत्परिवर्तन मूल्यांकन

दैहिक बनाम जर्मलाइन मूल्यांकन यह तय करने का कार्य है कि क्या कोई प्रकार विरासत में मिला था और प्रत्येक कोशिका (जर्मलाइन) में मौजूद था या जीवन के दौरान अधिग्रहित किया गया था और एक ऊतक जैसे ट्यूमर (दैहिक) तक सीमित था। यह अंतर यह नियंत्रित करता है कि एक प्रकार की व्याख्या कैसे की जाती है, कौन सा वर्गीकरण ढांचा लागू होता है, और रिश्तेदारों के लिए इसका क्या अर्थ है, इसलिए यह आणविक व्याख्या में एक मूलभूत कदम है।

Definition

दैहिक बनाम जर्मलाइन उत्परिवर्तन मूल्यांकन यह निर्धारित करना है कि क्या पता लगाया गया प्रकार विरासत में मिला है और संवैधानिक (जर्मलाइन) है या दैहिक ऊतक (दैहिक) में अधिग्रहित किया गया है, आमतौर पर ट्यूमर और सामान्य नमूनों की तुलना और प्रकार एलील अंश का उपयोग करके, ताकि सही व्याख्यात्मक ढांचा लागू किया जा सके।

Scope

यह प्रविष्टि दैहिक और जर्मलाइन भिन्नता के बीच जैविक अंतर, उन्हें अलग बताने के लिए उपयोग किए जाने वाले प्रयोगशाला दृष्टिकोण, दो सेटिंग्स के बीच व्याख्या लक्ष्यों में भिन्नता, और ट्यूमर परीक्षण के दौरान सामने आने वाले आकस्मिक या द्वितीयक जर्मलाइन निष्कर्षों के निहितार्थों को शामिल करती है। यह एक पद्धतिगत संदर्भ विषय है, नैदानिक ​​मार्गदर्शन नहीं।

Core questions

• दैहिक और जर्मलाइन प्रकारों के बीच जैविक अंतर क्या है?
• प्रयोगशाला में एक प्रकार की उत्पत्ति कैसे निर्धारित की जाती है?
• दैहिक और जर्मलाइन व्याख्या लक्ष्य क्यों भिन्न होते हैं?
• ट्यूमर परीक्षण के दौरान अप्रत्याशित जर्मलाइन निष्कर्षों को कैसे संभाला जाता है?

Key concepts

• जर्मलाइन (संवैधानिक) प्रकार
• दैहिक (अधिग्रहित) प्रकार
• ट्यूमर-सामान्य युग्मित परीक्षण
• प्रकार एलील अंश
• नैदानिक ​​कार्यक्षमता (दैहिक)
• वंशानुगत जोखिम (जर्मलाइन)
• आकस्मिक जर्मलाइन निष्कर्ष

Mechanisms

जर्मलाइन प्रकार अनिवार्य रूप से सभी कोशिकाओं में मौजूद होते हैं और विरासत में मिलते हैं, इसलिए वे किसी भी ऊतक में लगभग विषमयुग्मजी या समरूप एलील अंशों पर दिखाई देते हैं और रक्त संबंधियों के लिए निहितार्थ रखते हैं। दैहिक प्रकार गर्भाधान के बाद विशिष्ट कोशिका वंशों के भीतर उत्पन्न होते हैं - विशेष रूप से कैंसर में - और आमतौर पर ट्यूमर सामग्री और क्लोनल संरचना (वोगेलस्टीन एट अल।, 2013) को दर्शाने वाले प्रकार एलील अंशों पर प्रभावित ऊतक तक सीमित होते हैं। उत्पत्ति को असाइन करने का सबसे सीधा तरीका युग्मित ट्यूमर-सामान्य परीक्षण है, ट्यूमर की तुलना एक संवैधानिक नमूने से करना; एलील अंश और जनसंख्या डेटाबेस सहायक संकेत प्रदान करते हैं जब एक मिलान सामान्य अनुपलब्ध होता है। दो सेटिंग्स विभिन्न लक्ष्यों के साथ विभिन्न ढांचों का उपयोग करती हैं: ACMG/AMP जर्मलाइन ढांचा पूछता है कि क्या कोई प्रकार वंशानुगत बीमारी का कारण बनता है (रिचर्ड्स एट अल।, 2015), जबकि AMP/ASCO/CAP ढांचा चिकित्सीय प्रासंगिकता जैसे नैदानिक ​​कार्यक्षमता द्वारा दैहिक प्रकारों को रैंक करता है (ली एट अल।, 2017)। बड़े संवैधानिक अनुक्रमण डेटासेट यह स्थापित करने में मदद करते हैं कि कौन से प्रकार सामान्य जर्मलाइन पृष्ठभूमि (डेवी एट अल।, 2016) हैं।

Clinical relevance

क्या कोई प्रकार दैहिक है या जर्मलाइन, यह रोगी के लिए और, जर्मलाइन प्रकारों के लिए, रिश्तेदारों के लिए इसके अर्थ को निर्धारित करता है, और यह आकार देता है कि निष्कर्षों की रिपोर्ट कैसे की जाती है - जिसमें ट्यूमर परीक्षण के दौरान आकस्मिक रूप से खोजे गए जर्मलाइन निष्कर्षों का प्रबंधन भी शामिल है। यह प्रविष्टि मूल्यांकन तर्क की व्याख्या करती है और व्यक्तिगत निदान, जोखिम परामर्श या उपचार का आधार नहीं है।

Evidence & guidelines

जर्मलाइन व्याख्या ACMG/AMP दिशानिर्देश (रिचर्ड्स एट अल।, 2015) का पालन करती है और दैहिक व्याख्या AMP/ASCO/CAP दिशानिर्देश (ली एट अल।, 2017) का पालन करती है; साथ में वे दो ढांचों को परिभाषित करते हैं जिनकी सही चयन प्रकार की उत्पत्ति का आकलन करने पर निर्भर करता है। जनसंख्या एक्सोम डेटासेट संवैधानिक भिन्नता की पृष्ठभूमि को दर्शाते हैं (डेवी एट अल।, 2016)।

History

कैंसर प्रकारों की दैहिक उत्पत्ति दशकों के ट्यूमर आनुवंशिकी के माध्यम से स्थापित की गई थी और जीनोम-स्केल ट्यूमर अनुक्रमण (वोगेलस्टीन एट अल।, 2013) द्वारा समेकित की गई थी। जैसे ही ट्यूमर प्रोफाइलिंग नियमित देखभाल में प्रवेश किया, दैहिक को जर्मलाइन निष्कर्षों से अलग करने की आवश्यकता - और आकस्मिक जर्मलाइन परिणामों का प्रबंधन करने के लिए - समर्पित रिपोर्टिंग मानकों को प्रेरित किया, जिसे 2017 AMP/ASCO/CAP दिशानिर्देश (ली एट अल।, 2017) में कैंसर के लिए औपचारिक रूप दिया गया।

Debates

ट्यूमर परीक्षण के दौरान खोजे गए आकस्मिक जर्मलाइन निष्कर्षों को कैसे संभाला जाना चाहिए?

केवल ट्यूमर या युग्मित परीक्षण उन प्रकारों को प्रकट कर सकता है जो वास्तव में जर्मलाइन हैं और रोगी और रिश्तेदारों के लिए चिकित्सकीय रूप से महत्वपूर्ण हैं; ऐसे निष्कर्षों की पुष्टि, रिपोर्ट और संदर्भ कैसे और कब किया जाए, यह एक चल रहा रिपोर्टिंग और नैतिकता का प्रश्न है।

Seminal works

• vogelstein-2013
• li-2017

Frequently asked questions

दैहिक और जर्मलाइन प्रकार के बीच क्या अंतर है?

एक जर्मलाइन प्रकार विरासत में मिला होता है और एक व्यक्ति की सभी कोशिकाओं में मौजूद होता है, जिसके रिश्तेदारों के लिए निहितार्थ होते हैं; एक दैहिक प्रकार जीवन के दौरान अधिग्रहित होता है और एक विशेष ऊतक तक सीमित होता है, जैसे कि एक ट्यूमर।

प्रयोगशालाएं कैसे बताती हैं कि कोई प्रकार दैहिक है या जर्मलाइन?

सबसे सीधा तरीका युग्मित ट्यूमर-सामान्य परीक्षण है जिसमें ट्यूमर की तुलना एक संवैधानिक नमूने से की जाती है; प्रकार एलील अंश और जनसंख्या डेटाबेस सहायक साक्ष्य प्रदान करते हैं जब एक मिलान सामान्य नमूना उपलब्ध नहीं होता है।