आनुवंशिक भिन्नता और उत्परिवर्तन के प्रकार
आनुवंशिक भिन्नता आनुवंशिकता और रोग का मूल आधार है: व्यक्तियों के बीच डीएनए अनुक्रम में अंतर, जो एक एकल क्षार के परिवर्तन से लेकर पूरे गुणसूत्र खंडों के लाभ या हानि तक होता है। यह क्षेत्र उत्परिवर्तन के मुख्य प्रकारों का तंत्र और पैमाने के अनुसार सर्वेक्षण करता है, जिसमें बिंदु उत्परिवर्तन से लेकर संरचनात्मक और प्रतिलिपि-संख्या परिवर्तन तक शामिल हैं, और नैदानिक रूप से उनका वर्णन और व्याख्या करने के लिए उपयोग किए जाने वाले सम्मेलनों का भी सर्वेक्षण करता है।
Definition
उत्परिवर्तन जीनोम के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम में एक वंशानुगत परिवर्तन है; उत्परिवर्तन प्रकार ऐसे परिवर्तन की श्रेणियां हैं जो उनके आणविक तंत्र (जैसे, क्षार प्रतिस्थापन, प्रविष्टि/विलोपन, पुनर्व्यवस्था) और उनके पैमाने (एकल न्यूक्लियोटाइड, एक्सॉन, जीन, गुणसूत्र खंड) द्वारा परिभाषित होते हैं।
Scope
यह क्षेत्र पाठक को यह समझने में मदद करता है कि डीएनए-अनुक्रम परिवर्तनों को कैसे वर्गीकृत और नामित किया जाता है, और अपने विषयों को आणविक पैमाने और परिणाम के अनुसार व्यवस्थित करता है: बिंदु उत्परिवर्तन और मिससेंस वेरिएंट; नॉनसेंस और फ्रेमशिफ्ट उत्परिवर्तन; स्प्लिस-साइट उत्परिवर्तन; गुणसूत्र संरचनात्मक भिन्नताएं; और प्रतिलिपि संख्या भिन्नता। यह इन्हें चिकित्सा आनुवंशिकी में संदर्भ अवधारणाओं और उनका वर्णन करने के लिए उपयोग किए जाने वाले मानकों (HGVS नामकरण, ACMG/AMP व्याख्या) के रूप में मानता है, न कि नैदानिक प्रबंधन मार्गदर्शन के रूप में।
Sub-topics
Key concepts
- बिंदु उत्परिवर्तन (प्रतिस्थापन)
- प्रविष्टि और विलोपन (इंडेल)
- रीडिंग फ्रेम और फ्रेमशिफ्ट
- कोडिंग बनाम गैर-कोडिंग परिवर्तन
- संरचनात्मक भिन्नता
- प्रतिलिपि संख्या भिन्नता
- डी नोवो बनाम वंशानुगत वेरिएंट
- रोगजनकता और वेरिएंट वर्गीकरण (ACMG/AMP)
- HGVS अनुक्रम-वेरिएंट नामकरण
Mechanisms
उत्परिवर्तन डीएनए प्रतिकृति और मरम्मत में त्रुटियों, पुनर्संयोजन और उत्परिवर्तनजनकों (mutagens) के संपर्क में आने से उत्पन्न होते हैं। इन्हें पैमाने के अनुसार समूहीकृत किया जाता है: छोटे पैमाने के अनुक्रम परिवर्तन (एकल-क्षार प्रतिस्थापन और छोटे प्रविष्टि या विलोपन) कोडॉन को बदलते या स्थानांतरित करते हैं और एक प्रोटीन को बदल सकते हैं, छोटा कर सकते हैं या समाप्त कर सकते हैं; स्प्लिस-साइट परिवर्तन उन संकेतों को बाधित करते हैं जो एक्सॉन सीमाओं को परिभाषित करते हैं; और बड़े पैमाने पर संरचनात्मक परिवर्तन (विलोपन, दोहराव, व्युत्क्रमण, स्थानान्तरण) और प्रतिलिपि संख्या भिन्नताएं बड़े जीनोमिक खंडों को पुनर्गठित या उनकी खुराक को बदल देती हैं। यह व्याख्या करना कि कोई दिया गया वेरिएंट सौम्य है या रोग-उत्पादक, ACMG/AMP मानदंडों जैसे मानकीकृत ढांचों पर निर्भर करता है, जबकि सुसंगत वर्णन HGVS नामकरण पर निर्भर करता है।
Clinical relevance
उत्परिवर्तन का प्रकार यह निर्धारित करता है कि नैदानिक आनुवंशिकी में एक वेरिएंट की जांच और रिपोर्ट कैसे की जाती है: छोटे अनुक्रम वेरिएंट, संरचनात्मक पुनर्व्यवस्थाएं और प्रतिलिपि संख्या परिवर्तन विभिन्न assays द्वारा पता लगाए जाते हैं और विभिन्न व्याख्यात्मक मानदंडों द्वारा तौले जाते हैं। इन श्रेणियों को समझना आनुवंशिक परीक्षण रिपोर्टों और साहित्य के महत्वपूर्ण पठन का समर्थन करता है; यह क्षेत्र बताता है कि भिन्नता को कैसे वर्गीकृत और नामित किया जाता है और यह व्यक्तिगत निदान या उपचार निर्णयों का आधार नहीं है।
Evidence & guidelines
सुसंगत वेरिएंट वर्णन HGVS सिफारिशों (डेन डुनन एट अल., 2016) का पालन करता है, और अनुक्रम वेरिएंट की नैदानिक व्याख्या व्यापक रूप से ACMG/AMP आम सहमति ढांचे (रिचर्ड्स एट अल., 2015) द्वारा निर्देशित होती है, जो सौम्य से रोगजनक तक पांच श्रेणियों में साक्ष्य को वर्गीकृत करती है।
Related topics
Seminal works
- richards-2015
- dendunnen-2016
- feuk-2006
Frequently asked questions
- उत्परिवर्तन के प्रकारों को कैसे वर्गीकृत किया जाता है?
- मुख्य रूप से आणविक तंत्र और पैमाने के अनुसार: एकल-क्षार प्रतिस्थापन (जिसमें मिससेंस और नॉनसेंस शामिल हैं), छोटे प्रविष्टि और विलोपन (जो फ्रेमशिफ्ट का कारण बन सकते हैं), स्प्लिस-साइट परिवर्तन, बड़े संरचनात्मक पुनर्व्यवस्थाएं, और प्रतिलिपि संख्या भिन्नता जो जीनोमिक खंडों की खुराक को बदल देती है।
- वेरिएंट और उत्परिवर्तन में क्या अंतर है?
- दोनों एक संदर्भ अनुक्रम से अंतर को संदर्भित करते हैं। वर्तमान अभ्यास अक्सर ऐसे किसी भी अंतर के लिए तटस्थ शब्द वेरिएंट को प्राथमिकता देता है और नैदानिक महत्व (सौम्य से रोगजनक) को ACMG/AMP ढांचे जैसे एक अलग, साक्ष्य-आधारित वर्गीकरण चरण के लिए आरक्षित रखता है।