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Llamada de picos de ChIP-seq bayesianoBayesian ChIP-seq peak calling applies probabilistic models — typically Poisson, negative binomial, or hidden Markov models with Bayesian inference — to detect genomic regions enriAnálisis bayesiano de variación del número de copiasBayesian copy number variation (CNV) analysis is a probabilistic framework for detecting genomic segments where an individual's DNA copy count deviates from the diploid norm. By plEstudio Bayesiano de Asociación a Nivel de Epigenoma (Bayesian EWAS)A Bayesian EWAS is a genome-scale association analysis that links epigenetic marks — most commonly CpG-site DNA methylation — to a phenotype or trait of interest, replacing or suppEstudio Bayesiano de Asociación Epigenómica Amplio en Investigación EducativaA Bayesian epigenome-wide association study (Bayesian EWAS) scans hundreds of thousands of DNA methylation sites across the genome to identify those statistically associated with aAnálisis bayesiano de eQTLBayesian eQTL analysis identifies genetic variants (eQTLs) that regulate gene expression by combining genotype and RNA-seq data within a probabilistic framework. Unlike frequentistAnálisis bayesiano de enriquecimiento de conjuntos de genesBayesian gene set enrichment analysis (Bayesian GSEA) applies a probabilistic framework to determine whether predefined sets of genes — representing biological pathways, cellular p

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Los métodos fundacionales más referenciados de este tema, en el orden en que se desarrollaron: un punto de partida si eres nuevo aquí.

  1. Análisis Filogenético Bayesiano1996–2001por Rannala & Yang (1996); operationalized by Huelsenbeck et al. (MrBayes, 2001)
  2. Análisis bayesiano de eQTL2000s–2010spor Matthew Stephens, David J. Balding (Bayesian framework for genetic association); extended by multiple groups for eQTL context
  3. Análisis bayesiano de enriquecimiento de conjuntos de genes2004–2007por Michael A. Newton, Frank A. Quintana and colleagues; building on Subramanian et al. GSEA framework
  4. Análisis Bayesiano de Metabolómica2005–2010por Simon Rogers, Mark Girolami and colleagues (Bayesian NMR metabolomics framework, ~2009); broader Bayesian metabolomics developed through 2000s–2010s
  5. GWAS bayesiano2007–2009 (formal statistical framework)por Matthew Stephens, David J. Balding, Jon Wakefield (key formalizers ca. 2007–2009)
  6. Análisis Bayesiano de Expresión Diferencial de ARNseq2010–2013por Kendziorski et al. (EBSeq); Hardcastle & Kelly (baySeq)
  7. Llamada de variantes bayesiana2010 (GATK framework); Bayesian genotyping principles preceded by Samtools/MAQ ~2008–2009por Mark DePristo, Eric Banks, and the Broad Institute GATK team
  8. Modelo de Mezcla SIAR2010por Andrew Parnell
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Llamada de picos de ChIP-seq bayesianoAnálisis bayesiano de variación del número de copiasEstudio Bayesiano de Asociación a Nivel de Epigenoma (Bayesian EWAS)Estudio Bayesiano de Asociación Epigenómica Amplio en Investigación EducativaAnálisis bayesiano de eQTLAnálisis bayesiano de enriquecimiento de conjuntos de genesGWAS bayesiano en investigación educativaGWAS bayesianoAnálisis Bayesiano de MetabolómicaAnálisis Bayesiano de Diversidad del MicrobiomaAnálisis bayesiano de enriquecimiento de víasAnálisis Filogenético BayesianoAnálisis Proteómico BayesianoAnálisis Bayesiano de Expresión Diferencial de ARNseqAlineamiento bayesiano de secuenciasAnálisis bayesiano de ARN mensajero de célula única (scRNA-seq)Llamada de variantes bayesianaLiofilización (secado por congelación)Experimento de Respuesta de Tabla de VidaAnálisis de enriquecimiento de conjuntos de genes basado en redesModelo de Mezcla SIAR

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