Alineamiento bayesiano de secuencias — Alineamiento probabilístico con cuantificación de la incertidumbre

El alineamiento bayesiano de secuencias trata la alineación de secuencias biológicas (ADN, ARN o proteínas) como un problema de inferencia probabilística en lugar de una optimización determinista. En lugar de devolver una única mejor alineación, muestrea de una distribución posterior sobre todas las alineaciones plausibles dadas un modelo de sustitución y prioris de penalización por huecos, cuantificando así la incertidumbre del alineamiento. Es particularmente valioso cuando los análisis posteriores, como la inferencia filogenética o la anotación funcional, son sensibles al error de alineamiento.