Análisis Filogenético Bayesiano — Inferencia de Árboles Evolutivos Basada en MCMC

El análisis filogenético bayesiano utiliza el teorema de Bayes y el muestreo de cadenas de Markov Monte Carlo (MCMC) para estimar la distribución de probabilidad posterior sobre árboles filogenéticos y parámetros del modelo, dados los datos de secuencia observados. A diferencia de los métodos de máxima verosimilitud con "bootstrap" que devuelven un único árbol óptimo, la inferencia bayesiana produce un conjunto creíble de árboles con probabilidades posteriores asociadas, proporcionando una medida fundamentada de la incertidumbre filogenética. Es el marco dominante para estimar tiempos de divergencia y relaciones ancestrales en la evolución molecular.