代谢表型

代谢表型是一种总结性标签——包括差代谢型、中等代谢型、正常代谢型或超快代谢型——用于描述一个人根据其所携带的变异等位基因组合，预计代谢特定酶底物的速度。这些类别将复杂的基因型转化为关于代谢能力的、可解释的陈述。本主题探讨基因型如何映射到代谢表型，以及这些表型术语如何实现标准化。

Definition

代谢表型是对个体针对特定药理基因的预计酶活性的分类描述——通常分为差代谢型、中等代谢型、正常代谢型或超快代谢型——通过推断其所遗传的两个等位基因（双倍体型）的功能而得出。

Scope

本主题涵盖了标准代谢表型类别、从双倍体型（遗传的等位基因对）推断表型的原理、用于CYP2D6等基因的活性评分方法，以及为使实验室报告结果保持一致而进行的术语协调工作。它是关于分类的参考材料，不提供剂量说明。

Core questions

• 个体的基因型如何转化为预测的代谢表型？
• 差代谢型、中等代谢型、正常代谢型和超快代谢型这些类别意味着什么？
• 活性评分方法如何从双倍体型分配表型？
• 为什么标准化的表型术语在不同实验室之间很重要？

Key concepts

• 双倍体型（遗传的等位基因对）
• 等位基因功能分配（无、降低、正常、增强）
• 活性评分
• 差代谢型、中等代谢型、正常代谢型和超快代谢型类别
• 基因型到表型的转化
• 标准化结果术语

Mechanisms

代谢基因的每个变异等位基因都被赋予一个功能——无功能、功能降低、正常功能或功能增强。将一个人携带的两个等位基因（其双倍体型）结合起来，可以得出预测的总体活性，对于某些基因，这可以数值化为活性评分，然后映射到表型类别。携带两个无功能等位基因的人预计为差代谢型，带有一个或两个正常等位基因的人为正常代谢型，基因重复可能产生超快代谢型，而中间组合则介于两者之间。由于这是基于基因型的预测，观察到的表型仍可能受到药物相互作用、器官功能和其他因素的影响。

Clinical relevance

代谢表型是代谢基因药物遗传学检测的实际输出，也是基因型信息用于解释的呈现形式。作为参考内容，本主题解释了这些类别的含义及其推导方式；它不说明任何表型应接受的剂量，这由合格临床医生根据验证过的临床指南应用于整体临床情况来确定。

Epidemiology

每个代谢类别中人群的比例因祖先群体而异，因为潜在的等位基因频率不同。对于某些酶，特定人群中有相当一部分是差代谢型或超快代谢型，这就是为什么表型解释需要附带人群数据。

History

不同代谢群体的概念源于早期的双生子和家族研究，这些研究显示出双峰的药物代谢分布。随着基因分型取代直接代谢测试，该领域需要一致的方法将基因型转化为表型标签，从而导致了CYP2D6的活性评分系统，以及2017年临床药物遗传学实施联盟（Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium）的共识，该共识规范了测试报告中使用的术语。

Debates

中等代谢型类别应如何定义？

不同的方案对差代谢型、中等代谢型和正常代谢型之间的活性评分界限有不同的划分，协调工作旨在达成共识，以便相同的基因型在不同实验室产生相同的表型标签。

Key figures

• Kelly Caudle
• Teri Klein
• Mary Relling
• Andrea Gaedigk

Seminal works

• caudle-2017
• weinshilboum-2003

Frequently asked questions

什么是差代谢型？

这是一种预测的表型，表明根据一个人携带的变异等位基因，相关酶的活性预计很低或没有活性，因此底物药物代谢非常缓慢；它是一种代谢能力的分类，而非治疗指导。

一个人的基因型预测表型是否可能与他们实际代谢药物的方式不同？

是的。表型是基于基因型的预测，而抑制或诱导酶的相互作用药物、肝肾疾病以及年龄等因素可能使观察到的代谢活性偏离基于基因型的预测。