Kiểu hình chuyển hóa

Kiểu hình chuyển hóa là một nhãn tóm tắt – kém, trung bình, bình thường hoặc siêu nhanh – mô tả tốc độ dự kiến một người chuyển hóa các cơ chất của một enzym cụ thể, dựa trên sự kết hợp của các alen biến thể mà họ mang. Các loại này chuyển đổi một kiểu gen phức tạp thành một tuyên bố có thể diễn giải được về khả năng chuyển hóa. Chủ đề này đề cập đến cách kiểu gen được ánh xạ tới kiểu hình chuyển hóa và cách các thuật ngữ kiểu hình đó đã được chuẩn hóa.

Definition

Kiểu hình chuyển hóa là một mô tả phân loại về hoạt động enzym dự kiến của một cá nhân đối với một gen dược lý nhất định – theo quy ước là người chuyển hóa kém, trung bình, bình thường hoặc siêu nhanh – được suy luận từ chức năng của hai alen được thừa hưởng (kiểu gen lưỡng bội).

Scope

Chủ đề này bao gồm các loại kiểu hình chuyển hóa tiêu chuẩn, nguyên tắc suy luận kiểu hình từ một kiểu gen lưỡng bội (cặp alen được thừa hưởng), phương pháp điểm hoạt động được sử dụng cho các gen như CYP2D6, và nỗ lực hài hòa thuật ngữ để các phòng thí nghiệm báo cáo kết quả một cách nhất quán. Đây là tài liệu tham khảo về phân loại và không cung cấp hướng dẫn về liều lượng.

Core questions

• Kiểu gen của một cá nhân được chuyển đổi thành kiểu hình chuyển hóa dự kiến như thế nào?
• Các loại người chuyển hóa kém, trung bình, bình thường và siêu nhanh có ý nghĩa gì?
• Phương pháp điểm hoạt động gán kiểu hình từ kiểu gen lưỡng bội như thế nào?
• Tại sao thuật ngữ kiểu hình được chuẩn hóa lại quan trọng giữa các phòng thí nghiệm?

Key concepts

• Kiểu gen lưỡng bội (cặp alen được thừa hưởng)
• Gán chức năng alen (không, giảm, bình thường, tăng)
• Điểm hoạt động
• Các loại người chuyển hóa kém, trung bình, bình thường và siêu nhanh
• Chuyển đổi kiểu gen sang kiểu hình
• Thuật ngữ kết quả được chuẩn hóa

Mechanisms

Mỗi alen biến thể của một gen chuyển hóa được gán một chức năng – không chức năng, giảm chức năng, chức năng bình thường hoặc tăng chức năng. Kết hợp hai alen mà một người mang (kiểu gen lưỡng bội của họ) sẽ cho ra một hoạt động tổng thể dự kiến, mà đối với một số gen được ghi nhận bằng số dưới dạng điểm hoạt động và sau đó được ánh xạ tới một loại kiểu hình. Một người mang hai alen không chức năng được dự đoán là người chuyển hóa kém, một hoặc hai alen bình thường cho ra người chuyển hóa bình thường, sự nhân đôi gen có thể tạo ra người chuyển hóa siêu nhanh, và các kết hợp trung gian nằm giữa. Bởi vì đây là một dự đoán từ kiểu gen, kiểu hình quan sát được vẫn có thể bị thay đổi bởi tương tác thuốc, chức năng cơ quan và các yếu tố khác.

Clinical relevance

Các kiểu hình chuyển hóa là kết quả thực tế của xét nghiệm dược lý di truyền đối với các gen chuyển hóa và là dạng mà thông tin kiểu gen được truyền đạt để diễn giải. Là nội dung tham khảo, chủ đề này giải thích ý nghĩa của các loại và cách chúng được suy ra; nó không nêu rõ liều lượng mà bất kỳ kiểu hình nào nên nhận, điều này được xác định bởi các hướng dẫn lâm sàng đã được xác nhận được áp dụng bởi các bác sĩ lâm sàng có trình độ cho toàn bộ tình huống lâm sàng.

Epidemiology

Tỷ lệ người trong mỗi loại chuyển hóa khác nhau đáng kể theo quần thể tổ tiên, bởi vì tần số alen cơ bản khác nhau. Đối với một số enzym, một phần đáng kể của một số quần thể là người chuyển hóa kém hoặc siêu nhanh, đó là lý do tại sao dữ liệu quần thể đi kèm với việc diễn giải kiểu hình.

History

Khái niệm về các nhóm chuyển hóa riêng biệt xuất hiện từ các nghiên cứu ban đầu về cặp song sinh và gia đình cho thấy sự phân bố chuyển hóa thuốc hai đỉnh. Khi việc định kiểu gen thay thế xét nghiệm chuyển hóa trực tiếp, lĩnh vực này cần những cách nhất quán để chuyển đổi kiểu gen thành các nhãn kiểu hình, dẫn đến hệ thống điểm hoạt động cho CYP2D6 và một sự đồng thuận của Hiệp hội Triển khai Dược lý Di truyền Lâm sàng năm 2017 chuẩn hóa các thuật ngữ được sử dụng trong các báo cáo xét nghiệm.

Debates

Loại người chuyển hóa trung bình nên được định nghĩa như thế nào?

Các sơ đồ khác nhau đã đặt ra các ranh giới điểm hoạt động giữa người chuyển hóa kém, trung bình và bình thường khác nhau, và các nỗ lực hài hòa đã tìm kiếm sự đồng thuận để cùng một kiểu gen cho ra cùng một nhãn kiểu hình giữa các phòng thí nghiệm.

Key figures

• Kelly Caudle
• Teri Klein
• Mary Relling
• Andrea Gaedigk

Seminal works

• caudle-2017
• weinshilboum-2003

Frequently asked questions

Người chuyển hóa kém có nghĩa là gì?

Đó là một kiểu hình dự kiến cho thấy rằng, dựa trên các alen biến thể mà một người mang, enzym liên quan được dự kiến có ít hoặc không có hoạt động, do đó các loại thuốc cơ chất được chuyển hóa rất chậm; đó là một phân loại khả năng chuyển hóa, không phải là hướng dẫn điều trị.

Kiểu hình dự đoán từ kiểu gen của một người có thể khác với cách họ thực sự chuyển hóa thuốc không?

Có. Kiểu hình là một dự đoán từ kiểu gen, và các yếu tố như thuốc tương tác ức chế hoặc cảm ứng enzym, bệnh gan hoặc thận, và tuổi tác có thể làm thay đổi hoạt động chuyển hóa quan sát được so với dự đoán dựa trên kiểu gen.