Байесовский анализ вариаций числа копий
Байесовский анализ вариаций числа копий (CNV) представляет собой вероятностную основу для обнаружения геномных сегментов, в которых число копий ДНК индивидуума отклоняется от диплоидной нормы. Размещая априорные распределения для состояний числа копий и обновляя их с помощью данных array CGH, SNP-массивов или данных секвенирования с учетом глубины прочтения, этот подход дает апостериорные вероятности для каждого состояния числа копий вдоль генома, обеспечивая статистически обоснованную количественную оценку неопределенности, которой не хватает частотным методам сегментации.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076 ↗
- Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Байесовский GWASБиоинформатика↔ сравнить
- Байесовский вызов вариантовБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ сравнить
- Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клетокБиоинформатика↔ сравнить
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →