Анализ дифференциальных вариаций числа копий — сравнительный анализ CNV / SCNA
Анализ дифференциальных вариаций числа копий (dCNV) идентифицирует геномные регионы, где число копий ДНК систематически различается между двумя условиями — например, опухоль против нормальной ткани, случай против контрольной группы или обработанные против необработанных клеток. Комбинируя данные об уровне считывания или интенсивности массива на уровне зондов со статистической сегментацией и групповым тестированием, он определяет соматические амплификации и делеции, которые могут способствовать развитию заболевания, и отличает рекуррентные драйверные события от фонового шума в когорте.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Биоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →