ScholarGate
Ассистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клеток

Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клеток (scCNV) обнаруживает амплификации и делеции геномных сегментов в отдельных клетках, позволяя исследователям разрешать интратуморальную гетерогенность, реконструировать клональную эволюцию и отличать злокачественные клетки от нормальных с разрешением на уровне отдельных клеток. Он может применяться непосредственно к данным полногеномного секвенирования отдельных клеток или выводиться из сигналов глубины прочтения в экспериментах scRNA-seq или scATAC-seq.

Открыть в MethodMindСкороВидеоСкороСкачать слайды

Читать метод полностью

Только для участников

Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.

Войти

Карта метода

Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.

Источники

  1. Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link
  2. Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link

Как цитировать эту страницу

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis

Какой метод?

Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.

Сравнить рядом

Упоминается в

ScholarGateSingle-cell Copy Number Variation Analysis (Single-cell Copy Number Variation Analysis). Получено 2026-06-15 из https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis · Набор данных: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026