Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клеток
Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клеток (scCNV) обнаруживает амплификации и делеции геномных сегментов в отдельных клетках, позволяя исследователям разрешать интратуморальную гетерогенность, реконструировать клональную эволюцию и отличать злокачественные клетки от нормальных с разрешением на уровне отдельных клеток. Он может применяться непосредственно к данным полногеномного секвенирования отдельных клеток или выводиться из сигналов глубины прочтения в экспериментах scRNA-seq или scATAC-seq.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ сравнить
- Одноклеточное эпигеном-широкое исследование ассоциаций (scEWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Одноклеточный GWASБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии генов в одноклеточной РНК-секвенированииБиоинформатика↔ сравнить
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ сравнить
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →