Вызов вариантов на уровне одиночных клеток — определение мутаций с клеточным разрешением
Вызов вариантов на уровне одиночных клеток — это биоинформатический конвейер, который идентифицирует варианты последовательности ДНК — варианты на уровне одиночных нуклеотидов (SNV), небольшие вставки и делеции, а также изменения числа копий — внутри отдельных клеток, а не в смеси клеток целой ткани. Разрешая ландшафт мутаций клетка за клеткой, он выявляет внутриопухолевую гетерогенность, клональную архитектуру и закономерности соматических мутаций, которые скрывает полногеномное секвенирование. Этот подход является центральным для геномики рака, биологии развития и любого исследования, где основным вопросом является генетическое разнообразие от клетки к клетке.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →