アクション可能な遺伝子-薬剤ペア

アクション可能な遺伝子-薬剤ペアとは、遺伝学的根拠が十分に強く、臨床的結果が十分に明確であるため、患者の遺伝子型を知ることが薬剤の使用方法を決定するのに役立つ特定の遺伝子-薬剤の組み合わせを指します。キュレーションされた知識ベースと実装コンソーシアムは、何千もの遺伝子-薬剤関連性の証拠を評価し、その一部をアクション可能であると指定します。このトピックでは、そのようなペアがどのように特定され、評価され、単に報告された関連性から区別されるかについて説明します。

Definition

アクション可能な遺伝子-薬剤ペアとは、キュレーションされ、評価された証拠が、個人の遺伝子型がその薬剤の安全性または有効性にとって情報価値があることを示しており、検証済みの臨床ガイドラインの下でその使用を導くために遺伝子型情報が使用され得る遺伝子-薬剤の組み合わせを指します。

Scope

このトピックは、アクション可能な遺伝子-薬剤ペアの概念、アクション可能性を決定するために使用される証拠評価フレームワーク、そのようなリストを維持するキュレーションされた知識リソースとガイドライン作成機関、および確立された遺伝子-薬剤関連性と臨床的にアクション可能な関連性との違いを扱います。これは、証拠がどのように整理されているかに関する参照資料であり、特定の薬剤に対する推奨される行動を明示的に述べるものではありません。

Core questions

• アクション可能な遺伝子-薬剤ペアと単に報告された関連性を区別するものは何ですか？
• 遺伝子-薬剤ペアの証拠はどのように評価され、キュレーションされますか？
• どの機関や知識リソースが遺伝子-薬剤ペアをアクション可能と指定しますか？
• 遺伝子-薬剤関連性は、研究結果からアクション可能なステータスにどのように移行しますか？

Key concepts

• 遺伝子-薬剤関連性とアクション可能性
• 証拠レベルと臨床的注釈
• キュレーションされた薬理ゲノミクス知識ベース
• 実装コンソーシアムとガイドライン作成機関
• 先制的検査と反応的検査の文脈
• 関連性の再現性と効果量

Mechanisms

アクション可能な遺伝子-薬剤ペアの特定は、単一の実験ではなく、証拠を統合するプロセスです。遺伝子と薬剤反応との間で報告された関連性は、文献から収集され、注釈が付けられ、証拠の強さ、一貫性、臨床的重要性について評価されます。キュレーションされた知識リソースは関連性に証拠レベルを割り当て、実装コンソーシアムや国内グループは、最も質の高いペアをレビューして、行動を起こすのに十分に確立されているかどうかを決定し、時にはそれらに対する構造化されたガイダンスを公開します。証拠が弱い、一貫性がない、または臨床的に軽微なペアは、文書化された関連性として残りますが、アクション可能とは分類されません。

Clinical relevance

アクション可能な遺伝子-薬剤ペアのリストは、処方目的で知る価値があると見なされる遺伝子型を定義し、処方前または処方時に薬理遺伝子を検査するプログラムの基盤となります。参照コンテンツとして、このトピックはペアがどのようにキュレーションされ、評価されるかを説明します。用量は指定せず、個別化された指示も与えません。これらはすべて、資格のある臨床医が適用する検証済みの臨床ガイドラインの領域です。

Epidemiology

関連するバリアントの頻度は集団間で異なるため、特定のアクション可能なペアの実用的な影響は集団によって異なり、証拠が蓄積され、キュレーションが成熟するにつれて、アクション可能と認識されるペアの数は時間とともに増加しています。

History

薬理遺伝学的関連性が増加するにつれて、この分野では、堅牢で有用な発見を予備的なものから区別する方法が必要となりました。PharmGKBなどの知識リソースは、遺伝子-薬剤の証拠の注釈付けと評価を開始し、Clinical Pharmacogenetics Implementation ConsortiumやDutch Pharmacogenetics Working Groupを含むコンソーシアムは、最も強力な関連性をアクション可能なガイダンスに変換するための構造化されたフレームワークを開発し、いくつかの医療システムで先制的な検査プログラムを支援しました。

Debates

どのような証拠閾値が遺伝子-薬剤ペアをアクション可能にするべきか？

グループによって、効果量、再現性、臨床転帰データなど、ペアがアクション可能と見なされる前に必要とされる証拠の量と種類が異なるため、アクション可能と非アクション可能の境界は、継続的な方法論的判断の問題となっています。

Key figures

• Mary Relling
• William Evans
• Teri Klein
• Henk-Jan Guchelaar
• Russ Altman

Seminal works

• relling-2015
• whirl-carrillo-2012
• swen-2011

Frequently asked questions

アクション可能な遺伝子-薬剤ペアは、臨床医に何をすべきかを正確に伝えますか？

いいえ。ペアをアクション可能と指定することは、遺伝子型がその薬剤にとって情報価値があると見なされることを意味します。具体的な行動（もしあれば）は、検証済みの臨床ガイドラインに定められており、資格のある臨床医が患者全体の状況を考慮して決定します。

なぜ一部の遺伝子-薬剤関連性のみがアクション可能と見なされるのですか？

多くの関連性が報告されていますが、証拠が弱い、一貫性がない、または臨床的に軽微なものもあります。キュレーションおよびガイドライン作成機関によってアクション可能と評価されるのは、十分に強力で再現性があり、意味のある証拠を持つものだけです。