Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza obogaćenosti putanjâ — Biološka analiza obogaćenosti putanjâ

Analiza obogaćenosti putanjâ (PEA) statistički je pristup koji uzima popis ciljnih gena ili proteina — obično izveden iz eksperimenta diferencijalne ekspresije ili proteomike — i identificira koje su unaprijed definirane biološke putanje ili skupine gena zastupljene češće nego što se očekuje slučajno. Mapiranjem pojedinačnih molekularnih promjena na kurirane baze znanja o putanjama kao što su KEGG, Gene Ontology ili Reactome, PEA prevodi duge popise gena u interpretativne biološke procese, čime postaje središnji alat u postanalizi eksperimenata visoke propusnosti omika.

Otvorite u MethodMindUskoroVideoUskoroPreuzmi prezentaciju

Pročitajte cijelu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.

Prijavite se

Karta metoda

Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.

Analiza obogaćenosti putanjâ

Analiza obogaćenja gensk…Analiza metabolomike Mrežna analiza obogaćiva…Analiza proteoma RNA-seq diferencijalna e…Analiza RNA-sekvencije p…Bayesian ChIP-seq poziva…Bayesijanska analiza eQTL Bayesian GSEA Bayesian GWAS

+43 više

Izvori

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Koja metoda?

Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ usporedi
Analiza metabolomikeBioinformatika↔ usporedi
Mrežna analiza obogaćivanja putovaBioinformatika↔ usporedi
Analiza proteomaBioinformatika↔ usporedi
RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi

Usporedi jedno uz drugo →

Citirana u

Bayesian ChIP-seq pozivanje vrhunaca Bayesijanska analiza eQTL Bayesian GSEA Bayesian GWAS Bayesian Metabolomics Analysis Bayesovska analiza obogaćenosti putanjom Bayesovska proteomska analiza Bayesian RNA-seq analiza razlike u ekspresiji Diferencijalna studija povezanosti epigenoma (Differential EWAS)Diferencijalna analiza eQTL Diferencijalna metabolomska analiza Diferencijalna analiza obogaćenja putova Diferencijalna proteomska analiza Analiza povezanosti na razini epigenoma (EWAS)Analiza eQTL Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Studija asocijacije na razini cijelog genoma (GWAS)Analiza eQTL-a potpomognuta strojnim učenjem Analiza obogaćenja skupova gena potpomognuta strojnim učenjem Analiza raznolikosti mikrobioma potpomognuta strojnim učenjem Diferencijalna analiza ekspresije RNA-seq potpomognuta strojnim učenjem Machine learning-assisted single-cell RNA-seq analysis Analiza metabolomike Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Multi-omski obogaćujuća analiza genskih skupova Analiza višestrukih omika Višeslojna analiza raznolikosti mikrobioma Višestruko-omsko proteomska analiza Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Mrežna analiza varijacija broja kopija Mrežna studija udruživanja na razini epigenoma (Network EWAS)Mrežna analiza eQTL Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova Mrežna GWA Mrežna analiza metaboloma Analiza raznolikosti mikrobioma temeljena na mrežama Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq Mrežna analiza jediničnih stanica RNA-seq Analiza proteoma RNA-seq diferencijalna ekspresija Analiza eQTL-a pojedinačnih stanica Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Jednoćelijska GWAS Analiza metabolomike pojedinačnih stanica Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanica Analiza diferencijalne ekspresije u jediničnim stanicama (scRNA-seq DE)Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza vremenskih serija metabolomike Analiza raznolikosti mikrobioma u vremenskim nizovima Analiza obogaćivanja vremenskih nizova putova Vremensko-sekvencijalna RNA-seq diferencijalna ekspresija Analiza vremenskih nizova jednostanične RNA-seq

Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →