Analiza vremenskih nizova jednostanične RNA-seq — Temporalna transkriptomika na rezoluciji jedne stanice
Analiza vremenskih nizova jedinstanične RNA-seq obuhvaća ekspresiju gena u više vremenskih točaka na rezoluciji jedne stanice kako bi se otkrilo kako populacije stanica nastaju, prelaze i razdvajaju se tijekom dinamičkih bioloških procesa kao što su razvoj, diferencijacija ili napredovanje bolesti. Kombiniranjem pseudovremenskog sortiranja, RNA brzine i testiranja diferencijalne dinamike, istraživači rekonstruiraju temporalnu putanju pojedinačnih stanica i identificiraju promjene u genetskoj regulaciji koje pokreću biološke prijelaze.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza eQTLBioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenosti putanjâBioinformatika↔ usporedi
- RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
Citirana u
Similar methods
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →