Mrežna analiza obogaćivanja putova
Mrežna analiza obogaćivanja putova integrira molekularne mreže interakcija — interakcije protein-protein, signalne grafove ili mreže regulatorne gena — s omika mjerenjima kako bi se identificirali biološki putovi koji su koordinirano promijenjeni u određenom stanju. Za razliku od klasičnih pristupa pretjerane zastupljenosti ili obogaćivanja skupa gena koji tretiraju gene puta kao neovisne liste, ova obitelj metoda propagira signale preko mrežnih rubova, hvatajući topologiju interakcija i otkrivajući disregulirane module koje bi obogaćivanje ravnim popisom propustilo.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ usporedi
Citirana u
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →