Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama — Dinamička obogaćenost putanjama kroz vremenske točke
Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama (TS-GSEA) proširuje klasični GSEA okvir kako bi otkrila biološki koordinirane genske skupove — putanje, pojmove iz ontologije gena ili kurirane potpise — čije kolektivne promjene ekspresije značajno variraju tijekom vremena. Umjesto usporedbe dviju vremenskih točaka, modelira cijelu vremensku putanju ekspresije gena kako bi identificirala koje funkcionalne programe se aktiviraju, potiskuju ili dinamički preoblikuju tijekom biološkog procesa poput razvoja, odgovora na terapiju ili progresije bolesti.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ usporedi
- Multi-omski obogaćujuća analiza genskih skupovaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenosti putanjâBioinformatika↔ usporedi
- RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
- Vremensko-sekvencijalna RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
Similar methods
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →