Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA) računalna je metoda koja pokazuje li unaprijed definirani skup gena — koji predstavlja biološki put, proces ili funkciju — statistički značajne, koordinirane razlike između dvaju bioloških stanja. Za razliku od jednostavnog filtriranja prema omjeru promjene (fold-change), GSEA radi na svim mjerenim genima rangiranima prema metrikom korelacije, otkrivajući suptilne, ali dosljedne pomake u cijelom putu, čak i kada nijedan pojedinačni gen ne prođe prag značajnosti.

Otvorite u MethodMindUskoroApply, compare, get guidance

Tools & resources

Preuzmi prezentaciju

Learn & explore

VideoUskoro

Pročitajte cijelu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.

Prijavite se

Karta metoda

Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)

Multi-omski obogaćujuća…Mrežna analiza obogaćeno…Analiza obogaćenosti put…RNA-seq diferencijalna e…Analiza RNA-sekvencije p…Bayesian GSEA Bayesian analiza raznoli…Bayesovska analiza oboga…Bayesian RNA-seq analiza…Diferencijalno pozivanje…

+27 više

Izvori

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Koja metoda?

Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.

Multi-omski obogaćujuća analiza genskih skupovaBioinformatika↔ usporedi
Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupovaBioinformatika↔ usporedi
Analiza obogaćenosti putanjâBioinformatika↔ usporedi
RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi

Usporedi jedno uz drugo →

Citirana u

Bayesian GSEA Bayesian analiza raznolikosti mikrobioma Bayesovska analiza obogaćenosti putanjom Bayesian RNA-seq analiza razlike u ekspresiji Diferencijalno pozivanje ChIP-seq vrhova Diferencijalna analiza obogaćenja putova Analiza eQTL Analiza obogaćenja skupova gena potpomognuta strojnim učenjem Analiza obogaćenja putova uz pomoć strojnog učenja Diferencijalna analiza ekspresije RNA-seq potpomognuta strojnim učenjem Machine learning-assisted single-cell RNA-seq analysis Analiza metabolomike Multi-omski obogaćujuća analiza genskih skupova Analiza višestrukih omika Višeslojna analiza raznolikosti mikrobioma Višeslojna analiza obogaćenosti putanjâ Višestruko-omsko proteomska analiza Analiza diferencijalne ekspresije iz multi-omike RNA-seq Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Mrežna analiza varijacija broja kopija Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova Mrežna GWA Mrežna analiza metaboloma Analiza raznolikosti mikrobioma temeljena na mrežama Mrežna analiza obogaćivanja putova Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq Mrežna analiza jediničnih stanica RNA-seq Analiza obogaćenosti putanjâ Analiza proteoma RNA-seq diferencijalna ekspresija Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanica Analiza diferencijalne ekspresije u jediničnim stanicama (scRNA-seq DE)Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza obogaćivanja vremenskih nizova putova Vremensko-sekvencijalna RNA-seq diferencijalna ekspresija Analiza vremenskih nizova jednostanične RNA-seq

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →