Jednoćelijska GWAS — Genetička analiza povezanosti specifična za tip stanice
Jednoćelijska GWAS (GWAS) je integrativni bioinformatički pipeline koji mapira signale studije genetičke povezanosti (GWAS) na krajolike transkriptomike pojedinačnih stanica kako bi se identificiralo koji tipovi stanica i pojedinačne stanice nose nerazmjerni genetički rizik za bolest ili osobinu. Korištenjem atlasa transkriptomike pojedinačnih stanica (scRNA-seq) uz sažetak statistika GWAS-a, pomiče se izvan povezanosti na razini tkiva kako bi se otkrio precizan stanični kontekst u kojem genetičke varijante povezane s bolešću iskazuju svoje učinke.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/single-cell-gwas
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza eQTLBioinformatika↔ usporedi
- Studija asocijacije na razini cijelog genoma (GWAS)Bioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenosti putanjâBioinformatika↔ usporedi
- RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza eQTL-a pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
Citirana u
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →