Višeomsko analiziranje jednolančane RNK (Multi-omics Single-Cell RNA-seq Analysis) — Integrativno multimodalno profiliranja jednolančane RNK na razini pojedinačnih stanica
Višeomsko analiziranje jednolančane RNK na razini pojedinačnih stanica integrira dva ili više molekularnih slojeva — kao što su ekspresija gena (scRNA-seq), dostupnost kromatina (scATAC-seq) ili obilje površinskih proteina (CITE-seq) — izmjerenih istodobno ili ko-profiliranih u istim pojedinačnim stanicama. Usklađivanjem tih modaliteta u zajedničkom niskodimenzionalnom prostoru, istraživači dobivaju mehanistički bogatiju sliku identiteta stanice, regulatornog stanja i fenotipa nego što to može pružiti bilo koji pojedinačni test.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Pozivanje vrhunaca ChIP-seqBioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ usporedi
- Analiza diferencijalne ekspresije iz multi-omike RNA-seqBioinformatika↔ usporedi
- Analiza obogaćenosti putanjâBioinformatika↔ usporedi
- RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →