ट्यूमर मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग और स्तरीकरण
ट्यूमर मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग और स्तरीकरण मॉलिक्यूलर पैथोलॉजी की वह शाखा है जो किसी कैंसर को उसके आनुवंशिक और आणविक परिवर्तनों द्वारा चित्रित करती है और उस जानकारी का उपयोग ट्यूमर को जैविक और चिकित्सकीय रूप से सार्थक उपसमूहों में वर्गीकृत करने के लिए करती है। यह केवल ऊतक के उद्गम और आकृति विज्ञान पर निर्भर रहने के बजाय, ट्यूमर के जीनोम, ट्रांसक्रिप्टोम और अन्य आणविक परतों को पढ़ता है ताकि यह परिभाषित किया जा सके कि इसे क्या चला रहा है और यह अन्य कैंसर से कैसे भिन्न है जो माइक्रोस्कोप के नीचे समान दिखते हैं।
Definition
ट्यूमर मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग ट्यूमर ऊतक या परिसंचारी ट्यूमर सामग्री में दैहिक परिवर्तनों - म्यूटेशन, कॉपी-नंबर परिवर्तन, संरचनात्मक पुनर्व्यवस्था और अन्य आणविक विशेषताओं - का व्यवस्थित पता लगाना है; मॉलिक्यूलर स्तरीकरण इन प्रोफाइल का उपयोग ट्यूमर को साझा जीव विज्ञान, पूर्वानुमान या अनुमानित प्रतिक्रिया वाले उपसमूहों में असाइन करने के लिए है।
Scope
यह क्षेत्र पाठक को ट्यूमर के आणविक लक्षण वर्णन से परिचित कराता है: जीनोमिक प्रोफाइलिंग और मल्टीजीन पैनल, ड्राइवर म्यूटेशन और हॉटस्पॉट जो कैंसर को शुरू और बनाए रखते हैं, क्रोमोसोमल पुनर्व्यवस्था से उत्पन्न होने वाले फ्यूजन जीन, प्रेडिक्टिव बायोमार्कर जो चिकित्सीय लक्ष्यों को इंगित करते हैं, और ट्यूमर म्यूटेशनल बर्डन और माइक्रोसेटेलाइट अस्थिरता जैसे जीनोम-व्यापी हस्ताक्षर। यह मॉलिक्यूलर ऑन्कोलॉजिक पैथोलॉजी में अवधारणाओं और साक्ष्यों का एक संदर्भ अवलोकन है, न कि किसी व्यक्तिगत रोगी के परीक्षण या उपचार के लिए एक प्रोटोकॉल।
Sub-topics
Core questions
- किसी दिए गए ट्यूमर को कौन से दैहिक परिवर्तन परिभाषित करते हैं, और उनमें से कौन से इसकी वृद्धि को बढ़ावा देने की संभावना रखते हैं?
- हिस्टोलॉजिकल रूप से समान दिखने वाले ट्यूमर को अलग-अलग आणविक उपसमूहों में कैसे अलग किया जा सकता है?
- कौन सी आणविक विशेषताएं किसी विशिष्ट चिकित्सा के प्रति प्रतिक्रिया या प्रतिरोध की भविष्यवाणी करती हैं?
- अनुक्रम वेरिएंट की व्याख्या और रिपोर्ट कैसे की जाती है ताकि निष्कर्ष प्रयोगशालाओं में प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य हों?
Key concepts
- दैहिक बनाम जर्मलाइन परिवर्तन
- ड्राइवर बनाम यात्री म्यूटेशन
- मल्टीजीन अनुक्रमण पैनल
- व्यापक जीनोमिक प्रोफाइलिंग
- ऑन्कोजेनिक सिग्नलिंग पाथवे
- प्रेडिक्टिव बनाम प्रोग्नोस्टिक बायोमार्कर
- वेरिएंट व्याख्या और स्तरीय रिपोर्टिंग
- मॉलिक्यूलर सबटाइपिंग और स्तरीकरण
Mechanisms
कैंसर पूरे जीनोम में दैहिक परिवर्तन जमा करते हैं, और इनमें से केवल एक उपसमूह - ड्राइवर - चयनात्मक वृद्धि लाभ प्रदान करते हैं जो एक ट्यूमर को परिभाषित करता है। प्रोफाइलिंग प्रौद्योगिकियां, विशेष रूप से बड़े पैमाने पर समानांतर (अगली पीढ़ी) अनुक्रमण, बिंदु म्यूटेशन, सम्मिलन और विलोपन, कॉपी-नंबर परिवर्तन, और कई जीनों में एक साथ संरचनात्मक पुनर्व्यवस्था का पता लगाती हैं, और तेजी से पूरे एक्सोम या जीनोम में। द कैंसर जीनोम एटलस जैसे बड़े समूहों के विश्लेषण से पता चला है कि ये परिवर्तन ऑन्कोजेनिक सिग्नलिंग पाथवे के एक सीमित सेट पर अभिसरण करते हैं, जो केवल उद्गम स्थल के बजाय साझा जीव विज्ञान द्वारा विविध ट्यूमर को समूहित करने के लिए वैचारिक आधार प्रदान करता है। पता लगाए गए वेरिएंट को फिर क्यूरेटेड साक्ष्य के खिलाफ व्याख्या किया जाता है और उन स्तरों में रिपोर्ट किया जाता है जो उनके नैदानिक और जैविक महत्व को दर्शाते हैं।
Clinical relevance
मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग कैंसर का आणविक शब्दों में वर्णन करने की आधुनिक प्रथा को रेखांकित करती है और सटीक ऑन्कोलॉजी के बहुत से हिस्से को रेखांकित करती है, जहां विशिष्ट परिवर्तनों द्वारा परिभाषित उपसमूहों का लक्षित उपचारों के संबंध में अध्ययन किया जाता है। एक संदर्भ क्षेत्र के रूप में यह बताता है कि ट्यूमर के बारे में आणविक साक्ष्य कैसे उत्पन्न, मान्य और वर्गीकृत किए जाते हैं; यह जीव विज्ञान और साक्ष्य की संरचना को चित्रित करता है और व्यक्तियों के लिए नैदानिक या उपचार सिफारिशों का स्रोत नहीं है।
Epidemiology
बड़ी ट्यूमर श्रृंखलाओं के व्यापक अनुक्रमण ने कैंसर के प्रकारों में ड्राइवर परिवर्तनों की व्यापकता का मानचित्रण किया है, यह दर्शाता है कि अधिकांश वयस्क ठोस ट्यूमर यात्री म्यूटेशन की एक बड़ी पृष्ठभूमि के खिलाफ ड्राइवर घटनाओं की एक छोटी संख्या ले जाते हैं, और यह कि वही पाथवे कई ट्यूमर प्रकारों में अलग-अलग आवृत्तियों पर दोहराए जाते हैं। ये कोहोर्ट विश्लेषण जनसंख्या-स्तर की तस्वीर प्रदान करते हैं जिसके खिलाफ एक व्यक्तिगत ट्यूमर की प्रोफाइल की व्याख्या की जाती है।
History
ट्यूमर लक्षण वर्णन बीसवीं सदी के अंत और इक्कीसवीं सदी की शुरुआत में आकृति विज्ञान और इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री से आणविक परिभाषा की ओर बढ़ा, क्योंकि व्यक्तिगत ऑन्कोजीन और ट्यूमर-सप्रेसर जीन की पहचान ने जीनोम-स्केल अध्ययनों को जन्म दिया। बड़े पैमाने पर समानांतर अनुक्रमण के आगमन ने नियमित नमूनों में एक साथ कई जीनों को प्रोफाइल करना संभव बना दिया, और बड़े कंसोर्टियम प्रयासों ने मानव कैंसर के आवर्ती परिवर्तनों और पाथवे को सूचीबद्ध किया। पेशेवर निकायों ने बाद में दैहिक वेरिएंट की व्याख्या और रिपोर्टिंग के लिए मानक जारी किए, जिससे मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग को नैदानिक पैथोलॉजी के एक परिभाषित क्षेत्र के रूप में समेकित किया गया।
Key figures
- Bert Vogelstein
- Kenneth Kinzler
- Victor Velculescu
Related topics
Seminal works
- vogelstein-2013
- sanchezvega-2018
- frampton-2013
Frequently asked questions
- मॉलिक्यूलर स्तरीकरण पारंपरिक ट्यूमर वर्गीकरण से कैसे भिन्न है?
- पारंपरिक वर्गीकरण मुख्य रूप से ऊतक के उद्गम और सूक्ष्म उपस्थिति के आधार पर ट्यूमर को समूहित करता है, जबकि मॉलिक्यूलर स्तरीकरण उन्हें उनके द्वारा किए गए आनुवंशिक और आणविक परिवर्तनों के आधार पर समूहित करता है, ताकि माइक्रोस्कोप के नीचे समान दिखने वाले ट्यूमर विभिन्न आणविक उपसमूहों में आ सकें, और विभिन्न अंगों के ट्यूमर एक साझा कर सकें।
- ड्राइवर और यात्री म्यूटेशन में क्या अंतर है?
- एक ड्राइवर म्यूटेशन एक चयनात्मक वृद्धि लाभ प्रदान करता है और कैंसर के विकास में योगदान देता है, जबकि एक यात्री म्यूटेशन रास्ते में प्राप्त होता है लेकिन स्वयं ट्यूमर के विकास को बढ़ावा नहीं देता है; दोनों को अलग करना मॉलिक्यूलर प्रोफाइलिंग का एक केंद्रीय लक्ष्य है।