Process / pipelineBioinformatics / omics

Bayesovská analýza variací počtu kopií

Bayesovská analýza variací počtu kopií (CNV) je pravděpodobnostní rámec pro detekci genomových segmentů, kde se počet kopií DNA jedince odchyluje od diploidní normy. Umístěním apriorních distribucí na stavy počtu kopií a jejich aktualizací pomocí dat z array CGH, SNP array nebo sekvenačních dat s hloubkou čtení tento přístup poskytuje aposteriorní pravděpodobnosti pro každý stav počtu kopií podél genomu, čímž zajišťuje statisticky podložené kvantifikace nejistoty, které metodám častostní segmentace chybí.

Otevřít v MethodMindJiž brzyVideoJiž brzyDownload slides

Přečíst celou metodu

Pouze pro členy

Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.

Přihlásit se

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Zdroje

  1. Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076
  2. Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008

Jak citovat tuto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateBayesian Copy Number Variation Analysis (Bayesian Copy Number Variation Analysis). Získáno 2026-06-15 z https://scholargate.app/cs/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis · Datová sada: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026