Извикване на варианти от единични клетки — откриване на мутации с клетъчна резолюция
Извикването на варианти от единични клетки е биоинформатичен конвейер, който идентифицира варианти в ДНК последователността — еднонуклеотидни варианти (SNVs), малки инсерции и делеции, и промени в броя на копията — в рамките на индивидуални клетки, а не в смес от тъканна маса. Чрез разрешаване на мутационния пейзаж клетка по клетка, той разкрива интртъморна хетерогенност, клонална архитектура и модели на соматични мутации, които секвенирането на маса прикрива. Подходът е централен за геномиката на рака, биологията на развитието и всяко проучване, където генетичното разнообразие клетка по клетка е основният въпрос.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →