Анализ на филогенетика на единични клетки — Реконструкция на дърво на произход с резолюция на единични клетки
Анализът на филогенетика на единични клетки реконструира еволюционни или онтогенетични дървета от данни от секвениране на единични клетки, проследявайки как индивидуалните клетки са се отклонили от общ предшественик. Като използва соматични мутации, баркодове, въведени чрез CRISPR, или промени в броя на копията като унаследими характеристики, този метод картографира клонални връзки в тумори, развиващи се тъкани или имунни репертоари с безпрецедентна клетъчна резолюция.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ сравняване
- Филогенетичен анализБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Вариантно призоваванеБиоинформатика↔ сравняване
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →