Анализ на вариациите в броя на копията на единични клетки
Анализът на вариациите в броя на копията на единични клетки (scCNV) открива увеличаване и загуба на геномни сегменти в отделни клетки, което позволява на изследователите да разрешат интратуморната хетерогенност, да реконструират клоналната еволюция и да разграничат злокачествени от нормални клетки с резолюция на единични клетки. Той може да се прилага директно към данни от секвениране на цял геном на единични клетки или да се изведе от сигналите за дълбочина на прочитане при експерименти с scRNA-seq или scATAC-seq.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ сравняване
- Проучване на асоциации на епигеномно ниво в единични клетки (scEWAS)Биоинформатика↔ сравняване
- Single-cell GWASБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на диференциална експресия при едноклетъчна РНК-секвенцияБиоинформатика↔ сравняване
- Вариантно призоваванеБиоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →