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次要发现和偶然发现

次要发现和偶然发现是超出最初检测原因的基因检测结果。偶然发现是意外遇到的,而次要发现是在一组明确定义的基因中主动寻找的,无论检测的主要指征是什么。两者都提出了一个问题:当广泛测序不可避免地揭示出比预期更多的信息时,应该寻找和报告哪些结果。

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Definition

次要发现是指在预定义基因组中,独立于检测指征而蓄意分析和报告的结果;而偶然发现是指在针对其他问题的分析过程中意外遇到的具有临床相关性的结果。

Scope

本主题区分了偶然发现和次要发现,阐述了维护一个明确的、定期更新的基因列表以进行蓄意次要分析的理由,并概述了决定哪些基因应纳入此类列表的标准,例如可操作性。它涉及围绕非预期结果的解释和政策结构,而非关于报告这些结果的个体临床决策。

Core questions

  • 次要发现与偶然发现有何不同?
  • 为什么要维护一个明确的基因列表用于蓄意次要分析?
  • 哪些标准(例如可操作性)决定了哪些基因被纳入?
  • 随着证据的演变,该列表如何变化?

Key concepts

  • 偶然发现与次要发现
  • 明确定义的次要发现基因列表
  • 临床可操作性
  • 选择退出和患者选择权
  • 列表的定期修订
  • 广泛测序中的报告范围

Mechanisms

当对某一指征进行外显子组或基因组测序时,数据不可避免地包含许多其他基因的信息。为了系统地处理这个问题,专业建议定义了一个最小基因列表,其中应蓄意寻找并报告已知的致病性变异作为次要发现,选择这些基因主要是因为相关的疾病被认为是医学上可操作的(Green et al., 2013)。该列表并非固定不变:随着证据和共识的变化,它在后续版本中得到了修订和扩展(Miller et al., 2021; Miller et al., 2023)。相比之下,偶然发现并非预先指定,而是在主要分析过程中意外出现的。

Clinical relevance

非预期结果的处理是广泛基因组检测中的一个核心解释和咨询问题,包括如何定义报告范围以及如何尊重患者的选择。本主题描述了次要发现和偶然发现的框架和标准;它是一个参考性说明,并不指导是否或如何向个体报告任何特定的发现。

Epidemiology

由于次要发现是在明确定义的基因组中寻找的,因此具有可报告次要发现的个体比例取决于所包含的基因和受检人群;列表在不同版本中的扩展会改变预期产出(Miller et al., 2021; Miller et al., 2023)。

History

随着临床外显子组和基因组测序的增长,非预期结果的问题变得不可避免。2013年的一份政策声明引入了一个明确的最小基因列表,用于检查可报告的次要发现,这些基因因其可操作性而被选中(Green et al., 2013)。此后,该列表通过后续版本得到了维护和定期更新,反映了关于哪些基因值得纳入的累积证据和不断变化的共识(Miller et al., 2021; Miller et al., 2023)。

Debates

哪些基因应该列入次要发现列表,患者是否应该能够拒绝?
自该列表引入以来,关于哪些基因符合蓄意报告的可操作性标准,以及如何尊重患者选择退出的偏好,一直存在争议,并塑造了其后续修订。

Key figures

  • Robert C. Green
  • David T. Miller
  • Leslie Biesecker

Related topics

Seminal works

  • green-2013
  • miller-2021
  • miller-2023

Frequently asked questions

次要发现和偶然发现有什么区别?
次要发现是无论检测原因如何,在预定义基因组中蓄意寻找的,而偶然发现是在分析原始问题时意外遇到的。
为什么有一个明确的次要发现基因列表?
广泛测序揭示的信息远超原始问题,因此,一个主要基于医学可操作性而选择的明确列表,为哪些额外结果应被蓄意检查和报告提供了持续的、基于证据的范围。

Methods for this concept

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