Chỉ định xét nghiệm và giá trị lâm sàng

Chỉ định xét nghiệm và giá trị lâm sàng liên quan đến câu hỏi liệu một xét nghiệm di truyền có nên được thực hiện hay không và liệu kết quả của nó có thể thay đổi bất cứ điều gì quan trọng hay không. Chỉ định là lý do lâm sàng biện minh cho việc xét nghiệm; giá trị lâm sàng là mức độ mà kết quả cải thiện kết quả sức khỏe hoặc quyết định. Một xét nghiệm có thể chính xác về mặt phân tích nhưng vẫn thiếu giá trị nếu kết quả của nó không làm thay đổi cách quản lý.

Definition

Chỉ định xét nghiệm là câu hỏi hoặc tình trạng lâm sàng biện minh cho việc yêu cầu một xét nghiệm di truyền, và giá trị lâm sàng là mức độ mà kết quả xét nghiệm cung cấp thông tin có ý nghĩa cho một quyết định sức khỏe hoặc cải thiện một kết quả, vượt ra ngoài việc chỉ có giá trị phân tích và lâm sàng.

Scope

Chủ đề này phân biệt các cấp độ khác nhau mà một xét nghiệm di truyền được đánh giá: độ chính xác phân tích (liệu xét nghiệm có đo đúng kiểu gen hay không), độ chính xác lâm sàng (liệu kiểu gen có liên quan đến kiểu hình hoặc bệnh hay không), và giá trị lâm sàng (liệu việc sử dụng kết quả có cải thiện kết quả hoặc quyết định hay không). Nó cũng bao gồm các chỉ định chẩn đoán, tiên lượng, sàng lọc người mang mầm bệnh và dược lý di truyền, cũng như cách lựa chọn chiến lược xét nghiệm dựa trên chỉ định. Đây là một tài liệu tham khảo về cách lập luận về sự phù hợp, không phải là một danh sách khi nào nên xét nghiệm cho từng bệnh nhân cụ thể.

Core questions

• Câu hỏi lâm sàng nào mà xét nghiệm này nhằm mục đích trả lời?
• Kết quả dương tính hay âm tính có thay đổi cách quản lý hoặc quyết định không?
• Độ chính xác phân tích, độ chính xác lâm sàng và giá trị lâm sàng khác nhau như thế nào?
• Chiến lược xét nghiệm nào phù hợp nhất với chỉ định?

Key concepts

• Độ chính xác phân tích
• Độ chính xác lâm sàng
• Giá trị lâm sàng
• Xét nghiệm chẩn đoán so với xét nghiệm tiên lượng
• Chỉ định dược lý di truyền
• Xác suất trước xét nghiệm và sự phù hợp kiểu hình
• Lựa chọn chiến lược xét nghiệm

Mechanisms

Việc lựa chọn một xét nghiệm bắt đầu từ chỉ định, điều này thiết lập xác suất trước xét nghiệm và các gen liên quan; điều này đến lượt nó xác định liệu một xét nghiệm mục tiêu, một bảng điều khiển dựa trên kiểu hình, hay giải trình tự toàn bộ exome/genome rộng rãi là phù hợp (Schwarze et al., 2018). Giá trị được xếp lớp lên độ chính xác: một kết quả trước tiên phải có giá trị phân tích và lâm sàng, và sau đó phải có khả năng hành động cho quyết định hiện tại. Xét nghiệm dược lý di truyền là một ví dụ rõ ràng về chuỗi giá trị, nơi một kiểu gen được liên kết thông qua mối quan hệ gen-thuốc đã được thiết lập với một hậu quả lâm sàng tiếp theo (Wang et al., 2011). Khung diễn giải mà một phòng thí nghiệm áp dụng cho kết quả, đến lượt nó, giả định rằng các biến thể được tìm thấy được đánh giá dựa trên bằng chứng tiêu chuẩn hóa (Richards et al., 2015).

Clinical relevance

Lập luận về các chỉ định và giá trị là cốt lõi để đánh giá liệu xét nghiệm di truyền có thêm giá trị hay không và để tư vấn về những gì một xét nghiệm có thể và không thể đạt được. Chủ đề này mô tả cách đánh giá sự phù hợp và giá trị; nó không quy định xét nghiệm nào nên được yêu cầu cho một cá nhân hoặc cấu thành lời khuyên chẩn đoán.

Epidemiology

Khi chi phí giải trình tự giảm, phạm vi các chỉ định mà xét nghiệm di truyền được xem xét đã mở rộng, nhưng đánh giá hệ thống các chiến lược giải trình tự rộng rãi cho thấy hiệu quả chi phí không đồng nhất và phụ thuộc vào ngữ cảnh, nhấn mạnh rằng sự sẵn có rộng rãi hơn không tự động chuyển thành giá trị (Schwarze et al., 2018).

History

Các khung đánh giá xét nghiệm di truyền đã phát triển từ các nguyên tắc chung về đánh giá xét nghiệm chẩn đoán sang các mô hình đặc thù về di truyền học, tách biệt độ chính xác phân tích, độ chính xác lâm sàng, giá trị lâm sàng và các hàm ý đạo đức, pháp lý và xã hội liên quan. Sự trưởng thành của các tiêu chuẩn diễn giải biến thể (Richards et al., 2015) và sự tích lũy bằng chứng dược lý di truyền (Wang et al., 2011) đã làm rõ sự khác biệt giữa một xét nghiệm chính xác và một xét nghiệm hữu ích.

Debates

Giá trị lâm sàng nên được định nghĩa và đo lường như thế nào?

Việc giá trị có nên được giới hạn trong những thay đổi trong quản lý và kết quả lâm sàng hay cũng nên bao gồm giá trị cá nhân và sinh sản rộng hơn vẫn còn gây tranh cãi, và cơ sở bằng chứng cho giá trị của nhiều xét nghiệm, đặc biệt là giải trình tự rộng rãi, vẫn chưa đầy đủ.

Key figures

• Heidi Rehm
• Howard McLeod

Seminal works

• richards-2015
• schwarze-2018
• wang-2011

Frequently asked questions

Sự khác biệt giữa độ chính xác lâm sàng và giá trị lâm sàng là gì?

Độ chính xác lâm sàng là liệu kiểu gen có liên quan đáng tin cậy đến bệnh hoặc kiểu hình hay không; giá trị lâm sàng là liệu việc sử dụng kết quả xét nghiệm có thực sự cải thiện một quyết định hoặc kết quả hay không. Một xét nghiệm có thể có giá trị nhưng thiếu giá trị nếu không có gì thay đổi do kết quả.

Tại sao chỉ định lại thúc đẩy việc lựa chọn xét nghiệm?

Chỉ định thiết lập các gen liên quan và xác suất trước xét nghiệm, điều này xác định liệu một xét nghiệm mục tiêu, một bảng điều khiển, hay giải trình tự rộng rãi là chiến lược phù hợp và cách cân bằng chi phí và sự không chắc chắn của nó.