Các Phát hiện Thứ cấp và Tình cờ

Các phát hiện thứ cấp và tình cờ là những kết quả di truyền nằm ngoài lý do ban đầu của việc xét nghiệm. Các phát hiện tình cờ được tìm thấy một cách bất ngờ, trong khi các phát hiện thứ cấp được chủ động tìm kiếm trong một tập hợp gen xác định bất kể chỉ định chính của xét nghiệm. Cả hai đều đặt ra câu hỏi về việc nên tìm kiếm và trả về những kết quả nào khi giải trình tự rộng rãi chắc chắn sẽ tiết lộ nhiều hơn những gì được yêu cầu.

Definition

Các phát hiện thứ cấp là kết quả trong một tập hợp gen được xác định trước, được phân tích và báo cáo một cách có chủ đích độc lập với chỉ định xét nghiệm, trong khi các phát hiện tình cờ là các kết quả có liên quan lâm sàng được tìm thấy một cách bất ngờ trong quá trình phân tích nhằm giải quyết một câu hỏi khác.

Scope

Chủ đề này phân biệt các phát hiện tình cờ với các phát hiện thứ cấp, mô tả lý do duy trì một danh sách gen xác định, được cập nhật định kỳ để phân tích thứ cấp có chủ đích, và phác thảo các tiêu chí, chẳng hạn như khả năng hành động, được sử dụng để quyết định gen nào thuộc danh sách đó. Nó đề cập đến cấu trúc diễn giải và chính sách xung quanh các kết quả không mong muốn, không phải các quyết định lâm sàng cá nhân về việc trả lại chúng.

Core questions

• Các phát hiện thứ cấp khác với các phát hiện tình cờ như thế nào?
• Tại sao phải duy trì một danh sách gen xác định để phân tích thứ cấp có chủ đích?
• Những tiêu chí nào, chẳng hạn như khả năng hành động, quyết định gen nào được đưa vào?
• Danh sách thay đổi như thế nào khi bằng chứng phát triển?

Key concepts

• Phát hiện tình cờ so với phát hiện thứ cấp
• Danh sách gen phát hiện thứ cấp được xác định
• Khả năng hành động lâm sàng
• Quyền từ chối và lựa chọn của bệnh nhân
• Sửa đổi danh sách định kỳ
• Phạm vi báo cáo trong giải trình tự rộng rãi

Mechanisms

Khi giải trình tự toàn bộ exome hoặc bộ gen được thực hiện cho một chỉ định, dữ liệu chắc chắn chứa thông tin về nhiều gen khác. Để xử lý vấn đề này một cách có hệ thống, các khuyến nghị chuyên môn đã xác định một danh sách gen tối thiểu trong đó các biến thể gây bệnh đã biết nên được chủ động tìm kiếm và báo cáo dưới dạng các phát hiện thứ cấp, được chọn chủ yếu vì các tình trạng liên quan được coi là có thể hành động về mặt y tế (Green et al., 2013). Danh sách này không cố định: nó đã được sửa đổi và mở rộng qua các phiên bản kế tiếp khi bằng chứng và sự đồng thuận thay đổi (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023). Ngược lại, các phát hiện tình cờ không được xác định trước mà phát sinh một cách bất ngờ trong quá trình phân tích chính.

Clinical relevance

Việc xử lý các kết quả không mong muốn là một vấn đề diễn giải và tư vấn trọng tâm trong xét nghiệm gen rộng rãi, bao gồm cách xác định phạm vi báo cáo và cách tôn trọng lựa chọn của bệnh nhân. Chủ đề này mô tả khuôn khổ và tiêu chí cho các phát hiện thứ cấp và tình cờ; nó là một tài liệu tham khảo và không chỉ đạo liệu có nên hoặc làm thế nào để trả lại bất kỳ phát hiện cụ thể nào cho một cá nhân.

Epidemiology

Vì các phát hiện thứ cấp được tìm kiếm trong một tập hợp gen xác định, tỷ lệ cá nhân có phát hiện thứ cấp có thể báo cáo được phụ thuộc vào các gen được đưa vào và quần thể được xét nghiệm; việc mở rộng danh sách qua các phiên bản làm thay đổi tỷ lệ dự kiến (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

History

Khi giải trình tự exome và bộ gen lâm sàng phát triển, câu hỏi về các kết quả không mong muốn trở nên không thể tránh khỏi, và một tuyên bố chính sách năm 2013 đã giới thiệu một danh sách gen tối thiểu được xác định để kiểm tra các phát hiện thứ cấp có thể báo cáo được, được chọn vì khả năng hành động (Green et al., 2013). Danh sách này kể từ đó đã được duy trì và cập nhật định kỳ thông qua các phiên bản kế tiếp, phản ánh bằng chứng tích lũy và sự đồng thuận thay đổi về những gen nào cần được đưa vào (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

Debates

Những gen nào nên có trong danh sách phát hiện thứ cấp, và bệnh nhân có nên được phép từ chối không?

Việc quyết định gen nào đáp ứng tiêu chí khả năng hành động để báo cáo có chủ đích, và làm thế nào để tôn trọng sở thích từ chối của bệnh nhân, đã gây tranh cãi kể từ khi danh sách được giới thiệu và đã định hình các sửa đổi kế tiếp của nó.

Key figures

• Robert C. Green
• David T. Miller
• Leslie Biesecker

Seminal works

• green-2013
• miller-2021
• miller-2023

Frequently asked questions

Sự khác biệt giữa phát hiện thứ cấp và phát hiện tình cờ là gì?

Phát hiện thứ cấp được chủ động tìm kiếm trong một tập hợp gen được xác định trước bất kể lý do xét nghiệm được yêu cầu, trong khi phát hiện tình cờ là một phát hiện được tìm thấy một cách bất ngờ trong khi phân tích cho câu hỏi ban đầu.

Tại sao có một danh sách gen xác định cho các phát hiện thứ cấp?

Giải trình tự rộng rãi tiết lộ nhiều hơn đáng kể so với câu hỏi ban đầu, vì vậy một danh sách xác định, được chọn chủ yếu vì khả năng hành động y tế, cung cấp một phạm vi nhất quán, dựa trên bằng chứng để các kết quả bổ sung được chủ động kiểm tra và báo cáo.